Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT82Q9NSB4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT82Q9NSB4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT82Q9NSB4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT82Q9NSB4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT82Q9NSB4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT82Q9NSB4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT82Q9NSB4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT82Q9NSB4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT82Q9NSB4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT82Q9NSB4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT82Q9NSB4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT82Q9NSB4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT82Q9NSB4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT82Q9NSB4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT82Q9NSB4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT82Q9NSB4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT82Q9NSB4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT82Q9NSB4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT82Q9NSB4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT82Q9NSB4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT82Q9NSB4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT82Q9NSB4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT82Q9NSB4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT82Q9NSB4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT82Q9NSB4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT82Q9NSB4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT82Q9NSB4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT82Q9NSB4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT82Q9NSB4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT82Q9NSB4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT82Q9NSB4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT82Q9NSB4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KRT82Q9NSB4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KRT82Q9NSB4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT82Q9NSB4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT82Q9NSB4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT82Q9NSB4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT82Q9NSB4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT82Q9NSB4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT82Q9NSB4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT82Q9NSB4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT82Q9NSB4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT82Q9NSB4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT82Q9NSB4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT82Q9NSB4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT82Q9NSB4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT82Q9NSB4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT82Q9NSB4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT82Q9NSB4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT82Q9NSB4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT82Q9NSB4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT82Q9NSB4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT82Q9NSB4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT82Q9NSB4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT82Q9NSB4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT82Q9NSB4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT82Q9NSB4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KRT82Q9NSB4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT82Q9NSB4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT82Q9NSB4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT82Q9NSB4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT82Q9NSB4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT82Q9NSB4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT82Q9NSB4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT82Q9NSB4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT82Q9NSB4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT82Q9NSB4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT82Q9NSB4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT82Q9NSB4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT82Q9NSB4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT82Q9NSB4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT82Q9NSB4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT82Q9NSB4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT82Q9NSB4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT82Q9NSB4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT82Q9NSB4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT82Q9NSB4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT82Q9NSB4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT82Q9NSB4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT82Q9NSB4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
KRT82Q9NSB4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT82Q9NSB4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT82Q9NSB4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT82Q9NSB4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT82Q9NSB4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KRT82Q9NSB4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT82Q9NSB4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT82Q9NSB4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT82Q9NSB4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT82Q9NSB4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT82Q9NSB4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT82Q9NSB4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT82Q9NSB4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT82Q9NSB4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT82Q9NSB4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT82Q9NSB4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT82Q9NSB4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT82Q9NSB4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT82Q9NSB4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms