Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASSF1Q9NS23 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF1Q9NS23 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RASSF1Q9NS23 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF1Q9NS23 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF1Q9NS23 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF1Q9NS23 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF1Q9NS23 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF1Q9NS23 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF1Q9NS23 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASSF1Q9NS23 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RASSF1Q9NS23 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RASSF1Q9NS23 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RASSF1Q9NS23 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASSF1Q9NS23 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASSF1Q9NS23 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RASSF1Q9NS23 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RASSF1Q9NS23 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
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