Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLE3Q9NRF9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLE3Q9NRF9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLE3Q9NRF9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
POLE3Q9NRF9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLE3Q9NRF9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLE3Q9NRF9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLE3Q9NRF9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLE3Q9NRF9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLE3Q9NRF9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLE3Q9NRF9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLE3Q9NRF9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLE3Q9NRF9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLE3Q9NRF9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLE3Q9NRF9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLE3Q9NRF9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
POLE3Q9NRF9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLE3Q9NRF9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLE3Q9NRF9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLE3Q9NRF9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLE3Q9NRF9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLE3Q9NRF9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLE3Q9NRF9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLE3Q9NRF9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLE3Q9NRF9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POLE3Q9NRF9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLE3Q9NRF9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLE3Q9NRF9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLE3Q9NRF9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLE3Q9NRF9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLE3Q9NRF9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POLE3Q9NRF9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POLE3Q9NRF9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLE3Q9NRF9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLE3Q9NRF9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLE3Q9NRF9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLE3Q9NRF9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLE3Q9NRF9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLE3Q9NRF9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLE3Q9NRF9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLE3Q9NRF9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLE3Q9NRF9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLE3Q9NRF9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLE3Q9NRF9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLE3Q9NRF9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLE3Q9NRF9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLE3Q9NRF9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLE3Q9NRF9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
POLE3Q9NRF9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLE3Q9NRF9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLE3Q9NRF9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLE3Q9NRF9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLE3Q9NRF9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLE3Q9NRF9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLE3Q9NRF9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLE3Q9NRF9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLE3Q9NRF9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLE3Q9NRF9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLE3Q9NRF9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLE3Q9NRF9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLE3Q9NRF9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLE3Q9NRF9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLE3Q9NRF9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLE3Q9NRF9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLE3Q9NRF9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLE3Q9NRF9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLE3Q9NRF9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLE3Q9NRF9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLE3Q9NRF9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLE3Q9NRF9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLE3Q9NRF9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLE3Q9NRF9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLE3Q9NRF9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLE3Q9NRF9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLE3Q9NRF9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLE3Q9NRF9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLE3Q9NRF9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLE3Q9NRF9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLE3Q9NRF9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms