Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GDF3Q9NR23 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GDF3Q9NR23 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GDF3Q9NR23 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GDF3Q9NR23 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GDF3Q9NR23 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GDF3Q9NR23 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GDF3Q9NR23 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GDF3Q9NR23 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GDF3Q9NR23 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GDF3Q9NR23 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GDF3Q9NR23 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GDF3Q9NR23 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GDF3Q9NR23 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GDF3Q9NR23 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GDF3Q9NR23 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GDF3Q9NR23 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GDF3Q9NR23 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GDF3Q9NR23 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GDF3Q9NR23 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GDF3Q9NR23 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GDF3Q9NR23 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GDF3Q9NR23 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GDF3Q9NR23 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GDF3Q9NR23 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GDF3Q9NR23 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GDF3Q9NR23 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GDF3Q9NR23 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GDF3Q9NR23 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GDF3Q9NR23 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GDF3Q9NR23 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GDF3Q9NR23 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GDF3Q9NR23 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GDF3Q9NR23 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GDF3Q9NR23 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GDF3Q9NR23 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GDF3Q9NR23 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GDF3Q9NR23 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GDF3Q9NR23 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GDF3Q9NR23 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GDF3Q9NR23 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GDF3Q9NR23 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GDF3Q9NR23 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GDF3Q9NR23 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GDF3Q9NR23 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GDF3Q9NR23 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GDF3Q9NR23 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GDF3Q9NR23 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GDF3Q9NR23 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GDF3Q9NR23 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GDF3Q9NR23 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GDF3Q9NR23 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GDF3Q9NR23 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GDF3Q9NR23 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GDF3Q9NR23 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GDF3Q9NR23 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GDF3Q9NR23 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GDF3Q9NR23 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GDF3Q9NR23 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GDF3Q9NR23 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GDF3Q9NR23 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GDF3Q9NR23 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GDF3Q9NR23 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GDF3Q9NR23 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GDF3Q9NR23 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GDF3Q9NR23 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GDF3Q9NR23 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GDF3Q9NR23 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
GDF3Q9NR23 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GDF3Q9NR23 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GDF3Q9NR23 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GDF3Q9NR23 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GDF3Q9NR23 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GDF3Q9NR23 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GDF3Q9NR23 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GDF3Q9NR23 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GDF3Q9NR23 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GDF3Q9NR23 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GDF3Q9NR23 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GDF3Q9NR23 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GDF3Q9NR23 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GDF3Q9NR23 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GDF3Q9NR23 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GDF3Q9NR23 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GDF3Q9NR23 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GDF3Q9NR23 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GDF3Q9NR23 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GDF3Q9NR23 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GDF3Q9NR23 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GDF3Q9NR23 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GDF3Q9NR23 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GDF3Q9NR23 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GDF3Q9NR23 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GDF3Q9NR23 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GDF3Q9NR23 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GDF3Q9NR23 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GDF3Q9NR23 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GDF3Q9NR23 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GDF3Q9NR23 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GDF3Q9NR23 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms