Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPRD1BQ9NQG5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RPRD1BQ9NQG5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPRD1BQ9NQG5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPRD1BQ9NQG5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPRD1BQ9NQG5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPRD1BQ9NQG5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPRD1BQ9NQG5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPRD1BQ9NQG5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPRD1BQ9NQG5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPRD1BQ9NQG5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPRD1BQ9NQG5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPRD1BQ9NQG5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPRD1BQ9NQG5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPRD1BQ9NQG5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPRD1BQ9NQG5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPRD1BQ9NQG5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPRD1BQ9NQG5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPRD1BQ9NQG5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPRD1BQ9NQG5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPRD1BQ9NQG5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPRD1BQ9NQG5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPRD1BQ9NQG5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPRD1BQ9NQG5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPRD1BQ9NQG5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPRD1BQ9NQG5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPRD1BQ9NQG5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPRD1BQ9NQG5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPRD1BQ9NQG5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPRD1BQ9NQG5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPRD1BQ9NQG5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPRD1BQ9NQG5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPRD1BQ9NQG5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPRD1BQ9NQG5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RPRD1BQ9NQG5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPRD1BQ9NQG5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPRD1BQ9NQG5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPRD1BQ9NQG5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPRD1BQ9NQG5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPRD1BQ9NQG5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPRD1BQ9NQG5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPRD1BQ9NQG5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPRD1BQ9NQG5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPRD1BQ9NQG5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPRD1BQ9NQG5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPRD1BQ9NQG5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPRD1BQ9NQG5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPRD1BQ9NQG5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPRD1BQ9NQG5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPRD1BQ9NQG5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPRD1BQ9NQG5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPRD1BQ9NQG5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPRD1BQ9NQG5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPRD1BQ9NQG5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPRD1BQ9NQG5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPRD1BQ9NQG5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPRD1BQ9NQG5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPRD1BQ9NQG5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPRD1BQ9NQG5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPRD1BQ9NQG5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RPRD1BQ9NQG5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RPRD1BQ9NQG5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RPRD1BQ9NQG5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPRD1BQ9NQG5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RPRD1BQ9NQG5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPRD1BQ9NQG5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPRD1BQ9NQG5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPRD1BQ9NQG5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPRD1BQ9NQG5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPRD1BQ9NQG5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPRD1BQ9NQG5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPRD1BQ9NQG5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPRD1BQ9NQG5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPRD1BQ9NQG5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPRD1BQ9NQG5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPRD1BQ9NQG5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPRD1BQ9NQG5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPRD1BQ9NQG5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPRD1BQ9NQG5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPRD1BQ9NQG5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPRD1BQ9NQG5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPRD1BQ9NQG5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPRD1BQ9NQG5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPRD1BQ9NQG5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPRD1BQ9NQG5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPRD1BQ9NQG5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPRD1BQ9NQG5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPRD1BQ9NQG5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPRD1BQ9NQG5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPRD1BQ9NQG5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPRD1BQ9NQG5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPRD1BQ9NQG5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPRD1BQ9NQG5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPRD1BQ9NQG5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPRD1BQ9NQG5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPRD1BQ9NQG5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPRD1BQ9NQG5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPRD1BQ9NQG5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPRD1BQ9NQG5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPRD1BQ9NQG5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms