Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYLDQ9NQC7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYLDQ9NQC7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYLDQ9NQC7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYLDQ9NQC7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYLDQ9NQC7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CYLDQ9NQC7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYLDQ9NQC7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYLDQ9NQC7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYLDQ9NQC7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CYLDQ9NQC7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYLDQ9NQC7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYLDQ9NQC7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYLDQ9NQC7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYLDQ9NQC7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYLDQ9NQC7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYLDQ9NQC7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYLDQ9NQC7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYLDQ9NQC7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYLDQ9NQC7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYLDQ9NQC7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CYLDQ9NQC7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CYLDQ9NQC7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYLDQ9NQC7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYLDQ9NQC7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYLDQ9NQC7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYLDQ9NQC7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYLDQ9NQC7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYLDQ9NQC7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CYLDQ9NQC7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYLDQ9NQC7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYLDQ9NQC7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYLDQ9NQC7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYLDQ9NQC7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYLDQ9NQC7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYLDQ9NQC7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYLDQ9NQC7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYLDQ9NQC7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYLDQ9NQC7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYLDQ9NQC7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYLDQ9NQC7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYLDQ9NQC7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYLDQ9NQC7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYLDQ9NQC7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYLDQ9NQC7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYLDQ9NQC7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYLDQ9NQC7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYLDQ9NQC7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYLDQ9NQC7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYLDQ9NQC7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYLDQ9NQC7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CYLDQ9NQC7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYLDQ9NQC7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYLDQ9NQC7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYLDQ9NQC7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYLDQ9NQC7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYLDQ9NQC7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYLDQ9NQC7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYLDQ9NQC7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYLDQ9NQC7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CYLDQ9NQC7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYLDQ9NQC7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYLDQ9NQC7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYLDQ9NQC7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYLDQ9NQC7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYLDQ9NQC7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYLDQ9NQC7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYLDQ9NQC7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYLDQ9NQC7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYLDQ9NQC7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYLDQ9NQC7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYLDQ9NQC7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYLDQ9NQC7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYLDQ9NQC7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYLDQ9NQC7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYLDQ9NQC7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYLDQ9NQC7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYLDQ9NQC7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYLDQ9NQC7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYLDQ9NQC7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYLDQ9NQC7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYLDQ9NQC7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CYLDQ9NQC7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYLDQ9NQC7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYLDQ9NQC7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYLDQ9NQC7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYLDQ9NQC7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CYLDQ9NQC7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYLDQ9NQC7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYLDQ9NQC7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYLDQ9NQC7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYLDQ9NQC7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYLDQ9NQC7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYLDQ9NQC7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYLDQ9NQC7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYLDQ9NQC7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CYLDQ9NQC7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CYLDQ9NQC7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYLDQ9NQC7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYLDQ9NQC7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
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