Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB9BQ9NP90 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB9BQ9NP90 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB9BQ9NP90 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB9BQ9NP90 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB9BQ9NP90 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB9BQ9NP90 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB9BQ9NP90 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB9BQ9NP90 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB9BQ9NP90 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB9BQ9NP90 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB9BQ9NP90 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB9BQ9NP90 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB9BQ9NP90 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB9BQ9NP90 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB9BQ9NP90 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB9BQ9NP90 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB9BQ9NP90 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB9BQ9NP90 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB9BQ9NP90 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB9BQ9NP90 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB9BQ9NP90 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB9BQ9NP90 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB9BQ9NP90 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB9BQ9NP90 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB9BQ9NP90 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB9BQ9NP90 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB9BQ9NP90 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB9BQ9NP90 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB9BQ9NP90 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB9BQ9NP90 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB9BQ9NP90 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB9BQ9NP90 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB9BQ9NP90 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB9BQ9NP90 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB9BQ9NP90 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB9BQ9NP90 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB9BQ9NP90 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB9BQ9NP90 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB9BQ9NP90 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB9BQ9NP90 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB9BQ9NP90 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB9BQ9NP90 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB9BQ9NP90 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB9BQ9NP90 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB9BQ9NP90 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB9BQ9NP90 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB9BQ9NP90 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB9BQ9NP90 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB9BQ9NP90 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB9BQ9NP90 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB9BQ9NP90 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB9BQ9NP90 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB9BQ9NP90 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB9BQ9NP90 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB9BQ9NP90 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB9BQ9NP90 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB9BQ9NP90 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB9BQ9NP90 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB9BQ9NP90 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB9BQ9NP90 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB9BQ9NP90 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB9BQ9NP90 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB9BQ9NP90 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB9BQ9NP90 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB9BQ9NP90 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB9BQ9NP90 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB9BQ9NP90 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB9BQ9NP90 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB9BQ9NP90 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB9BQ9NP90 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB9BQ9NP90 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB9BQ9NP90 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB9BQ9NP90 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB9BQ9NP90 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB9BQ9NP90 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB9BQ9NP90 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB9BQ9NP90 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB9BQ9NP90 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB9BQ9NP90 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB9BQ9NP90 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB9BQ9NP90 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB9BQ9NP90 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB9BQ9NP90 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB9BQ9NP90 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB9BQ9NP90 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB9BQ9NP90 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB9BQ9NP90 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB9BQ9NP90 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB9BQ9NP90 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB9BQ9NP90 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB9BQ9NP90 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB9BQ9NP90 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB9BQ9NP90 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB9BQ9NP90 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB9BQ9NP90 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB9BQ9NP90 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB9BQ9NP90 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB9BQ9NP90 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB9BQ9NP90 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms