Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCB9Q9NP78 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCB9Q9NP78 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCB9Q9NP78 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCB9Q9NP78 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCB9Q9NP78 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCB9Q9NP78 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCB9Q9NP78 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCB9Q9NP78 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCB9Q9NP78 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCB9Q9NP78 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCB9Q9NP78 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCB9Q9NP78 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCB9Q9NP78 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCB9Q9NP78 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB9Q9NP78 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCB9Q9NP78 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB9Q9NP78 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB9Q9NP78 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCB9Q9NP78 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB9Q9NP78 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB9Q9NP78 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB9Q9NP78 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB9Q9NP78 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCB9Q9NP78 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB9Q9NP78 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB9Q9NP78 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCB9Q9NP78 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB9Q9NP78 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB9Q9NP78 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB9Q9NP78 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCB9Q9NP78 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCB9Q9NP78 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCB9Q9NP78 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCB9Q9NP78 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCB9Q9NP78 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCB9Q9NP78 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCB9Q9NP78 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCB9Q9NP78 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB9Q9NP78 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB9Q9NP78 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB9Q9NP78 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB9Q9NP78 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCB9Q9NP78 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB9Q9NP78 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB9Q9NP78 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB9Q9NP78 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCB9Q9NP78 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB9Q9NP78 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCB9Q9NP78 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCB9Q9NP78 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB9Q9NP78 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB9Q9NP78 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB9Q9NP78 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCB9Q9NP78 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCB9Q9NP78 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCB9Q9NP78 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB9Q9NP78 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB9Q9NP78 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB9Q9NP78 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB9Q9NP78 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB9Q9NP78 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB9Q9NP78 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB9Q9NP78 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB9Q9NP78 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB9Q9NP78 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB9Q9NP78 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB9Q9NP78 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB9Q9NP78 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB9Q9NP78 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB9Q9NP78 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB9Q9NP78 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB9Q9NP78 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB9Q9NP78 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB9Q9NP78 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB9Q9NP78 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB9Q9NP78 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB9Q9NP78 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB9Q9NP78 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB9Q9NP78 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB9Q9NP78 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB9Q9NP78 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB9Q9NP78 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB9Q9NP78 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB9Q9NP78 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB9Q9NP78 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCB9Q9NP78 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB9Q9NP78 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCB9Q9NP78 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB9Q9NP78 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB9Q9NP78 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCB9Q9NP78 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCB9Q9NP78 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCB9Q9NP78 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB9Q9NP78 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCB9Q9NP78 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB9Q9NP78 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB9Q9NP78 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB9Q9NP78 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCB9Q9NP78 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms