Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN4

GPN1, GPN-loop GTPase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN1Q9HCN4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPN1Q9HCN4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPN1Q9HCN4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPN1Q9HCN4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPN1Q9HCN4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPN1Q9HCN4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPN1Q9HCN4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPN1Q9HCN4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPN1Q9HCN4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPN1Q9HCN4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPN1Q9HCN4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPN1Q9HCN4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPN1Q9HCN4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPN1Q9HCN4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPN1Q9HCN4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPN1Q9HCN4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPN1Q9HCN4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPN1Q9HCN4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPN1Q9HCN4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPN1Q9HCN4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPN1Q9HCN4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPN1Q9HCN4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPN1Q9HCN4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPN1Q9HCN4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPN1Q9HCN4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPN1Q9HCN4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPN1Q9HCN4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPN1Q9HCN4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPN1Q9HCN4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPN1Q9HCN4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPN1Q9HCN4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPN1Q9HCN4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPN1Q9HCN4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPN1Q9HCN4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPN1Q9HCN4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPN1Q9HCN4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPN1Q9HCN4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPN1Q9HCN4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPN1Q9HCN4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPN1Q9HCN4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPN1Q9HCN4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPN1Q9HCN4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPN1Q9HCN4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPN1Q9HCN4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPN1Q9HCN4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPN1Q9HCN4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPN1Q9HCN4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GPN1Q9HCN4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPN1Q9HCN4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPN1Q9HCN4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPN1Q9HCN4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPN1Q9HCN4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPN1Q9HCN4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPN1Q9HCN4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPN1Q9HCN4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPN1Q9HCN4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPN1Q9HCN4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPN1Q9HCN4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPN1Q9HCN4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPN1Q9HCN4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPN1Q9HCN4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPN1Q9HCN4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPN1Q9HCN4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPN1Q9HCN4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPN1Q9HCN4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GPN1Q9HCN4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPN1Q9HCN4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPN1Q9HCN4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPN1Q9HCN4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPN1Q9HCN4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPN1Q9HCN4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPN1Q9HCN4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPN1Q9HCN4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPN1Q9HCN4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPN1Q9HCN4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPN1Q9HCN4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPN1Q9HCN4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPN1Q9HCN4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPN1Q9HCN4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPN1Q9HCN4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPN1Q9HCN4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPN1Q9HCN4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPN1Q9HCN4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPN1Q9HCN4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPN1Q9HCN4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPN1Q9HCN4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPN1Q9HCN4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPN1Q9HCN4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPN1Q9HCN4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPN1Q9HCN4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPN1Q9HCN4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPN1Q9HCN4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPN1Q9HCN4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPN1Q9HCN4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPN1Q9HCN4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPN1Q9HCN4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPN1Q9HCN4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPN1Q9HCN4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPN1Q9HCN4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPN1Q9HCN4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms