Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6I2

SOX17, Transcription factor SOX-17, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17Q9H6I2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX17Q9H6I2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX17Q9H6I2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX17Q9H6I2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX17Q9H6I2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX17Q9H6I2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX17Q9H6I2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX17Q9H6I2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX17Q9H6I2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX17Q9H6I2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX17Q9H6I2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX17Q9H6I2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX17Q9H6I2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX17Q9H6I2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX17Q9H6I2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX17Q9H6I2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SOX17Q9H6I2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX17Q9H6I2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX17Q9H6I2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX17Q9H6I2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX17Q9H6I2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX17Q9H6I2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOX17Q9H6I2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SOX17Q9H6I2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX17Q9H6I2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX17Q9H6I2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX17Q9H6I2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX17Q9H6I2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX17Q9H6I2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX17Q9H6I2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX17Q9H6I2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX17Q9H6I2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOX17Q9H6I2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOX17Q9H6I2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOX17Q9H6I2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOX17Q9H6I2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX17Q9H6I2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX17Q9H6I2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX17Q9H6I2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOX17Q9H6I2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX17Q9H6I2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX17Q9H6I2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX17Q9H6I2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX17Q9H6I2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX17Q9H6I2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX17Q9H6I2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX17Q9H6I2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX17Q9H6I2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX17Q9H6I2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX17Q9H6I2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX17Q9H6I2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX17Q9H6I2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX17Q9H6I2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX17Q9H6I2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX17Q9H6I2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX17Q9H6I2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX17Q9H6I2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX17Q9H6I2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX17Q9H6I2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX17Q9H6I2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX17Q9H6I2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX17Q9H6I2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX17Q9H6I2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX17Q9H6I2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX17Q9H6I2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX17Q9H6I2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX17Q9H6I2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX17Q9H6I2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX17Q9H6I2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX17Q9H6I2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX17Q9H6I2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX17Q9H6I2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX17Q9H6I2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX17Q9H6I2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX17Q9H6I2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX17Q9H6I2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX17Q9H6I2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX17Q9H6I2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX17Q9H6I2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX17Q9H6I2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX17Q9H6I2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX17Q9H6I2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX17Q9H6I2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX17Q9H6I2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX17Q9H6I2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX17Q9H6I2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX17Q9H6I2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX17Q9H6I2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX17Q9H6I2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX17Q9H6I2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX17Q9H6I2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX17Q9H6I2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX17Q9H6I2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX17Q9H6I2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX17Q9H6I2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX17Q9H6I2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX17Q9H6I2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX17Q9H6I2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX17Q9H6I2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX17Q9H6I2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms