Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLMPQ9H6B4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CLMPQ9H6B4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLMPQ9H6B4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLMPQ9H6B4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLMPQ9H6B4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLMPQ9H6B4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CLMPQ9H6B4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLMPQ9H6B4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLMPQ9H6B4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLMPQ9H6B4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLMPQ9H6B4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLMPQ9H6B4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLMPQ9H6B4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLMPQ9H6B4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLMPQ9H6B4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLMPQ9H6B4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLMPQ9H6B4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLMPQ9H6B4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLMPQ9H6B4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLMPQ9H6B4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLMPQ9H6B4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLMPQ9H6B4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLMPQ9H6B4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLMPQ9H6B4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLMPQ9H6B4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLMPQ9H6B4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CLMPQ9H6B4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLMPQ9H6B4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLMPQ9H6B4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLMPQ9H6B4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLMPQ9H6B4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLMPQ9H6B4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLMPQ9H6B4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLMPQ9H6B4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLMPQ9H6B4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLMPQ9H6B4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLMPQ9H6B4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLMPQ9H6B4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLMPQ9H6B4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLMPQ9H6B4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLMPQ9H6B4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLMPQ9H6B4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLMPQ9H6B4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLMPQ9H6B4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLMPQ9H6B4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLMPQ9H6B4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLMPQ9H6B4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLMPQ9H6B4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLMPQ9H6B4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLMPQ9H6B4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLMPQ9H6B4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLMPQ9H6B4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLMPQ9H6B4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLMPQ9H6B4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLMPQ9H6B4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLMPQ9H6B4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLMPQ9H6B4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLMPQ9H6B4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLMPQ9H6B4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CLMPQ9H6B4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLMPQ9H6B4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLMPQ9H6B4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLMPQ9H6B4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLMPQ9H6B4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CLMPQ9H6B4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLMPQ9H6B4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLMPQ9H6B4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLMPQ9H6B4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLMPQ9H6B4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLMPQ9H6B4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLMPQ9H6B4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLMPQ9H6B4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLMPQ9H6B4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLMPQ9H6B4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLMPQ9H6B4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLMPQ9H6B4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLMPQ9H6B4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLMPQ9H6B4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLMPQ9H6B4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLMPQ9H6B4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLMPQ9H6B4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CLMPQ9H6B4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLMPQ9H6B4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLMPQ9H6B4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLMPQ9H6B4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLMPQ9H6B4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLMPQ9H6B4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLMPQ9H6B4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLMPQ9H6B4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CLMPQ9H6B4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLMPQ9H6B4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLMPQ9H6B4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLMPQ9H6B4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLMPQ9H6B4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLMPQ9H6B4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLMPQ9H6B4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLMPQ9H6B4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLMPQ9H6B4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLMPQ9H6B4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms