Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1A7

POLR2J3, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J3Q9H1A7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2J3Q9H1A7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2J3Q9H1A7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2J3Q9H1A7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2J3Q9H1A7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2J3Q9H1A7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2J3Q9H1A7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2J3Q9H1A7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2J3Q9H1A7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2J3Q9H1A7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2J3Q9H1A7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2J3Q9H1A7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2J3Q9H1A7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2J3Q9H1A7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2J3Q9H1A7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2J3Q9H1A7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2J3Q9H1A7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2J3Q9H1A7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2J3Q9H1A7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2J3Q9H1A7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2J3Q9H1A7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2J3Q9H1A7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2J3Q9H1A7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2J3Q9H1A7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2J3Q9H1A7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR2J3Q9H1A7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2J3Q9H1A7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2J3Q9H1A7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2J3Q9H1A7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2J3Q9H1A7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2J3Q9H1A7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2J3Q9H1A7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2J3Q9H1A7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2J3Q9H1A7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2J3Q9H1A7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2J3Q9H1A7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2J3Q9H1A7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2J3Q9H1A7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2J3Q9H1A7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR2J3Q9H1A7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR2J3Q9H1A7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR2J3Q9H1A7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2J3Q9H1A7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2J3Q9H1A7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2J3Q9H1A7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2J3Q9H1A7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2J3Q9H1A7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POLR2J3Q9H1A7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2J3Q9H1A7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2J3Q9H1A7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2J3Q9H1A7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2J3Q9H1A7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2J3Q9H1A7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2J3Q9H1A7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2J3Q9H1A7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2J3Q9H1A7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2J3Q9H1A7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2J3Q9H1A7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2J3Q9H1A7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2J3Q9H1A7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2J3Q9H1A7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2J3Q9H1A7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR2J3Q9H1A7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2J3Q9H1A7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2J3Q9H1A7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2J3Q9H1A7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2J3Q9H1A7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2J3Q9H1A7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2J3Q9H1A7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2J3Q9H1A7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2J3Q9H1A7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2J3Q9H1A7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2J3Q9H1A7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2J3Q9H1A7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2J3Q9H1A7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2J3Q9H1A7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2J3Q9H1A7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2J3Q9H1A7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2J3Q9H1A7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2J3Q9H1A7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2J3Q9H1A7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2J3Q9H1A7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2J3Q9H1A7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2J3Q9H1A7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2J3Q9H1A7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2J3Q9H1A7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2J3Q9H1A7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2J3Q9H1A7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2J3Q9H1A7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR2J3Q9H1A7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR2J3Q9H1A7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2J3Q9H1A7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2J3Q9H1A7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2J3Q9H1A7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2J3Q9H1A7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2J3Q9H1A7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2J3Q9H1A7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2J3Q9H1A7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2J3Q9H1A7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2J3Q9H1A7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms