Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC113Q9H0I3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC113Q9H0I3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC113Q9H0I3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC113Q9H0I3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC113Q9H0I3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC113Q9H0I3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC113Q9H0I3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC113Q9H0I3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC113Q9H0I3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC113Q9H0I3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC113Q9H0I3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC113Q9H0I3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC113Q9H0I3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC113Q9H0I3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC113Q9H0I3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC113Q9H0I3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC113Q9H0I3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC113Q9H0I3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC113Q9H0I3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC113Q9H0I3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC113Q9H0I3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC113Q9H0I3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC113Q9H0I3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC113Q9H0I3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC113Q9H0I3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC113Q9H0I3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC113Q9H0I3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC113Q9H0I3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC113Q9H0I3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC113Q9H0I3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC113Q9H0I3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC113Q9H0I3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC113Q9H0I3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC113Q9H0I3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC113Q9H0I3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC113Q9H0I3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC113Q9H0I3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC113Q9H0I3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC113Q9H0I3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC113Q9H0I3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC113Q9H0I3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC113Q9H0I3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC113Q9H0I3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC113Q9H0I3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC113Q9H0I3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC113Q9H0I3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC113Q9H0I3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC113Q9H0I3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC113Q9H0I3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC113Q9H0I3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC113Q9H0I3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC113Q9H0I3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC113Q9H0I3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC113Q9H0I3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC113Q9H0I3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC113Q9H0I3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC113Q9H0I3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC113Q9H0I3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC113Q9H0I3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC113Q9H0I3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC113Q9H0I3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC113Q9H0I3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC113Q9H0I3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC113Q9H0I3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC113Q9H0I3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC113Q9H0I3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC113Q9H0I3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC113Q9H0I3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC113Q9H0I3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC113Q9H0I3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC113Q9H0I3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC113Q9H0I3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC113Q9H0I3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC113Q9H0I3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC113Q9H0I3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC113Q9H0I3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC113Q9H0I3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC113Q9H0I3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC113Q9H0I3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC113Q9H0I3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC113Q9H0I3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC113Q9H0I3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC113Q9H0I3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC113Q9H0I3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC113Q9H0I3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC113Q9H0I3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC113Q9H0I3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC113Q9H0I3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC113Q9H0I3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC113Q9H0I3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC113Q9H0I3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC113Q9H0I3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC113Q9H0I3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC113Q9H0I3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC113Q9H0I3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC113Q9H0I3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC113Q9H0I3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC113Q9H0I3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC113Q9H0I3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms