Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0H3

KLHL25, Kelch-like protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL25Q9H0H3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL25Q9H0H3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL25Q9H0H3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL25Q9H0H3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL25Q9H0H3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL25Q9H0H3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL25Q9H0H3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL25Q9H0H3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL25Q9H0H3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL25Q9H0H3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL25Q9H0H3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL25Q9H0H3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL25Q9H0H3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL25Q9H0H3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL25Q9H0H3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL25Q9H0H3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL25Q9H0H3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL25Q9H0H3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL25Q9H0H3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL25Q9H0H3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL25Q9H0H3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL25Q9H0H3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms