Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0H3

KLHL25, Kelch-like protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL25Q9H0H3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL25Q9H0H3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KLHL25Q9H0H3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL25Q9H0H3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL25Q9H0H3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL25Q9H0H3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL25Q9H0H3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL25Q9H0H3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL25Q9H0H3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL25Q9H0H3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL25Q9H0H3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL25Q9H0H3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL25Q9H0H3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL25Q9H0H3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL25Q9H0H3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL25Q9H0H3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL25Q9H0H3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL25Q9H0H3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL25Q9H0H3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL25Q9H0H3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL25Q9H0H3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL25Q9H0H3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL25Q9H0H3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL25Q9H0H3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL25Q9H0H3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL25Q9H0H3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms