Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXP3Q9BZS1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXP3Q9BZS1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXP3Q9BZS1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXP3Q9BZS1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXP3Q9BZS1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXP3Q9BZS1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXP3Q9BZS1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXP3Q9BZS1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXP3Q9BZS1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXP3Q9BZS1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXP3Q9BZS1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXP3Q9BZS1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXP3Q9BZS1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXP3Q9BZS1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXP3Q9BZS1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXP3Q9BZS1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXP3Q9BZS1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXP3Q9BZS1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXP3Q9BZS1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXP3Q9BZS1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXP3Q9BZS1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FOXP3Q9BZS1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FOXP3Q9BZS1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXP3Q9BZS1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXP3Q9BZS1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXP3Q9BZS1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXP3Q9BZS1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXP3Q9BZS1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXP3Q9BZS1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXP3Q9BZS1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXP3Q9BZS1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXP3Q9BZS1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXP3Q9BZS1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXP3Q9BZS1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXP3Q9BZS1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXP3Q9BZS1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXP3Q9BZS1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXP3Q9BZS1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXP3Q9BZS1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXP3Q9BZS1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXP3Q9BZS1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXP3Q9BZS1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXP3Q9BZS1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXP3Q9BZS1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXP3Q9BZS1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXP3Q9BZS1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXP3Q9BZS1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXP3Q9BZS1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXP3Q9BZS1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXP3Q9BZS1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXP3Q9BZS1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXP3Q9BZS1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXP3Q9BZS1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXP3Q9BZS1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXP3Q9BZS1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXP3Q9BZS1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXP3Q9BZS1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXP3Q9BZS1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXP3Q9BZS1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXP3Q9BZS1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXP3Q9BZS1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXP3Q9BZS1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXP3Q9BZS1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXP3Q9BZS1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FOXP3Q9BZS1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXP3Q9BZS1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXP3Q9BZS1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXP3Q9BZS1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXP3Q9BZS1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXP3Q9BZS1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXP3Q9BZS1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXP3Q9BZS1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXP3Q9BZS1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXP3Q9BZS1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXP3Q9BZS1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXP3Q9BZS1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXP3Q9BZS1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXP3Q9BZS1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXP3Q9BZS1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FOXP3Q9BZS1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FOXP3Q9BZS1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXP3Q9BZS1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXP3Q9BZS1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXP3Q9BZS1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXP3Q9BZS1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXP3Q9BZS1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXP3Q9BZS1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXP3Q9BZS1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXP3Q9BZS1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXP3Q9BZS1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXP3Q9BZS1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXP3Q9BZS1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXP3Q9BZS1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXP3Q9BZS1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXP3Q9BZS1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXP3Q9BZS1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXP3Q9BZS1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXP3Q9BZS1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXP3Q9BZS1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms