Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GTPBP4Q9BZE4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GTPBP4Q9BZE4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTPBP4Q9BZE4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
GTPBP4Q9BZE4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTPBP4Q9BZE4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GTPBP4Q9BZE4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GTPBP4Q9BZE4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
GTPBP4Q9BZE4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GTPBP4Q9BZE4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTPBP4Q9BZE4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTPBP4Q9BZE4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTPBP4Q9BZE4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GTPBP4Q9BZE4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
GTPBP4Q9BZE4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GTPBP4Q9BZE4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GTPBP4Q9BZE4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GTPBP4Q9BZE4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GTPBP4Q9BZE4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GTPBP4Q9BZE4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GTPBP4Q9BZE4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GTPBP4Q9BZE4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GTPBP4Q9BZE4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GTPBP4Q9BZE4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GTPBP4Q9BZE4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GTPBP4Q9BZE4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GTPBP4Q9BZE4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GTPBP4Q9BZE4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
GTPBP4Q9BZE4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GTPBP4Q9BZE4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GTPBP4Q9BZE4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GTPBP4Q9BZE4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GTPBP4Q9BZE4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
GTPBP4Q9BZE4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GTPBP4Q9BZE4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GTPBP4Q9BZE4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GTPBP4Q9BZE4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GTPBP4Q9BZE4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GTPBP4Q9BZE4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GTPBP4Q9BZE4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GTPBP4Q9BZE4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GTPBP4Q9BZE4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GTPBP4Q9BZE4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GTPBP4Q9BZE4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GTPBP4Q9BZE4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GTPBP4Q9BZE4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GTPBP4Q9BZE4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GTPBP4Q9BZE4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
GTPBP4Q9BZE4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GTPBP4Q9BZE4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GTPBP4Q9BZE4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
GTPBP4Q9BZE4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GTPBP4Q9BZE4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GTPBP4Q9BZE4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GTPBP4Q9BZE4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GTPBP4Q9BZE4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GTPBP4Q9BZE4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GTPBP4Q9BZE4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GTPBP4Q9BZE4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GTPBP4Q9BZE4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GTPBP4Q9BZE4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GTPBP4Q9BZE4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GTPBP4Q9BZE4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GTPBP4Q9BZE4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GTPBP4Q9BZE4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GTPBP4Q9BZE4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GTPBP4Q9BZE4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GTPBP4Q9BZE4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GTPBP4Q9BZE4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GTPBP4Q9BZE4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GTPBP4Q9BZE4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GTPBP4Q9BZE4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GTPBP4Q9BZE4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTPBP4Q9BZE4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTPBP4Q9BZE4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTPBP4Q9BZE4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
GTPBP4Q9BZE4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GTPBP4Q9BZE4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GTPBP4Q9BZE4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GTPBP4Q9BZE4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GTPBP4Q9BZE4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GTPBP4Q9BZE4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GTPBP4Q9BZE4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GTPBP4Q9BZE4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GTPBP4Q9BZE4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GTPBP4Q9BZE4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GTPBP4Q9BZE4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GTPBP4Q9BZE4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GTPBP4Q9BZE4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GTPBP4Q9BZE4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GTPBP4Q9BZE4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GTPBP4Q9BZE4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GTPBP4Q9BZE4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GTPBP4Q9BZE4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GTPBP4Q9BZE4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GTPBP4Q9BZE4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GTPBP4Q9BZE4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GTPBP4Q9BZE4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GTPBP4Q9BZE4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GTPBP4Q9BZE4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms