Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB1

LGR4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR4Q9BXB1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LGR4Q9BXB1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LGR4Q9BXB1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LGR4Q9BXB1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LGR4Q9BXB1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LGR4Q9BXB1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LGR4Q9BXB1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LGR4Q9BXB1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LGR4Q9BXB1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LGR4Q9BXB1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LGR4Q9BXB1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LGR4Q9BXB1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LGR4Q9BXB1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LGR4Q9BXB1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LGR4Q9BXB1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LGR4Q9BXB1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LGR4Q9BXB1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LGR4Q9BXB1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LGR4Q9BXB1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LGR4Q9BXB1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LGR4Q9BXB1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LGR4Q9BXB1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR4Q9BXB1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR4Q9BXB1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR4Q9BXB1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR4Q9BXB1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR4Q9BXB1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LGR4Q9BXB1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGR4Q9BXB1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGR4Q9BXB1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGR4Q9BXB1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGR4Q9BXB1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LGR4Q9BXB1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LGR4Q9BXB1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LGR4Q9BXB1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LGR4Q9BXB1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LGR4Q9BXB1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LGR4Q9BXB1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LGR4Q9BXB1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LGR4Q9BXB1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LGR4Q9BXB1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LGR4Q9BXB1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LGR4Q9BXB1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LGR4Q9BXB1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LGR4Q9BXB1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LGR4Q9BXB1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LGR4Q9BXB1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LGR4Q9BXB1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LGR4Q9BXB1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LGR4Q9BXB1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LGR4Q9BXB1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LGR4Q9BXB1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LGR4Q9BXB1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LGR4Q9BXB1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LGR4Q9BXB1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LGR4Q9BXB1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LGR4Q9BXB1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LGR4Q9BXB1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LGR4Q9BXB1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LGR4Q9BXB1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LGR4Q9BXB1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LGR4Q9BXB1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LGR4Q9BXB1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LGR4Q9BXB1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LGR4Q9BXB1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LGR4Q9BXB1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LGR4Q9BXB1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LGR4Q9BXB1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LGR4Q9BXB1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LGR4Q9BXB1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LGR4Q9BXB1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LGR4Q9BXB1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LGR4Q9BXB1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LGR4Q9BXB1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LGR4Q9BXB1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LGR4Q9BXB1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LGR4Q9BXB1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LGR4Q9BXB1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LGR4Q9BXB1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LGR4Q9BXB1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LGR4Q9BXB1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LGR4Q9BXB1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LGR4Q9BXB1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LGR4Q9BXB1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LGR4Q9BXB1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LGR4Q9BXB1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LGR4Q9BXB1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LGR4Q9BXB1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LGR4Q9BXB1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LGR4Q9BXB1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LGR4Q9BXB1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LGR4Q9BXB1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LGR4Q9BXB1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LGR4Q9BXB1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LGR4Q9BXB1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LGR4Q9BXB1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LGR4Q9BXB1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LGR4Q9BXB1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LGR4Q9BXB1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LGR4Q9BXB1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms