Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PLVAPQ9BX97 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PLVAPQ9BX97 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLVAPQ9BX97 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLVAPQ9BX97 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLVAPQ9BX97 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLVAPQ9BX97 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLVAPQ9BX97 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLVAPQ9BX97 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLVAPQ9BX97 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLVAPQ9BX97 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PLVAPQ9BX97 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLVAPQ9BX97 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLVAPQ9BX97 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLVAPQ9BX97 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLVAPQ9BX97 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLVAPQ9BX97 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PLVAPQ9BX97 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLVAPQ9BX97 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLVAPQ9BX97 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PLVAPQ9BX97 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PLVAPQ9BX97 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PLVAPQ9BX97 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PLVAPQ9BX97 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PLVAPQ9BX97 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PLVAPQ9BX97 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PLVAPQ9BX97 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PLVAPQ9BX97 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PLVAPQ9BX97 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PLVAPQ9BX97 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PLVAPQ9BX97 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLVAPQ9BX97 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PLVAPQ9BX97 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PLVAPQ9BX97 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLVAPQ9BX97 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PLVAPQ9BX97 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PLVAPQ9BX97 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PLVAPQ9BX97 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PLVAPQ9BX97 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLVAPQ9BX97 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLVAPQ9BX97 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PLVAPQ9BX97 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLVAPQ9BX97 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLVAPQ9BX97 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PLVAPQ9BX97 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLVAPQ9BX97 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLVAPQ9BX97 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLVAPQ9BX97 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLVAPQ9BX97 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PLVAPQ9BX97 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PLVAPQ9BX97 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PLVAPQ9BX97 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PLVAPQ9BX97 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PLVAPQ9BX97 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PLVAPQ9BX97 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PLVAPQ9BX97 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLVAPQ9BX97 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLVAPQ9BX97 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLVAPQ9BX97 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLVAPQ9BX97 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLVAPQ9BX97 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLVAPQ9BX97 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLVAPQ9BX97 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLVAPQ9BX97 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLVAPQ9BX97 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLVAPQ9BX97 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLVAPQ9BX97 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PLVAPQ9BX97 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLVAPQ9BX97 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLVAPQ9BX97 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLVAPQ9BX97 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLVAPQ9BX97 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLVAPQ9BX97 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLVAPQ9BX97 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PLVAPQ9BX97 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
PLVAPQ9BX97 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLVAPQ9BX97 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLVAPQ9BX97 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PLVAPQ9BX97 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PLVAPQ9BX97 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLVAPQ9BX97 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLVAPQ9BX97 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLVAPQ9BX97 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLVAPQ9BX97 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PLVAPQ9BX97 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLVAPQ9BX97 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLVAPQ9BX97 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLVAPQ9BX97 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PLVAPQ9BX97 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PLVAPQ9BX97 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PLVAPQ9BX97 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLVAPQ9BX97 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLVAPQ9BX97 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLVAPQ9BX97 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLVAPQ9BX97 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLVAPQ9BX97 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLVAPQ9BX97 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLVAPQ9BX97 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLVAPQ9BX97 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLVAPQ9BX97 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms