Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX69

CARD6, Caspase recruitment domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD6Q9BX69 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARD6Q9BX69 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARD6Q9BX69 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARD6Q9BX69 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARD6Q9BX69 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARD6Q9BX69 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARD6Q9BX69 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CARD6Q9BX69 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARD6Q9BX69 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARD6Q9BX69 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CARD6Q9BX69 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARD6Q9BX69 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARD6Q9BX69 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARD6Q9BX69 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CARD6Q9BX69 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARD6Q9BX69 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CARD6Q9BX69 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARD6Q9BX69 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CARD6Q9BX69 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARD6Q9BX69 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARD6Q9BX69 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARD6Q9BX69 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARD6Q9BX69 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARD6Q9BX69 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARD6Q9BX69 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARD6Q9BX69 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARD6Q9BX69 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARD6Q9BX69 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARD6Q9BX69 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARD6Q9BX69 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARD6Q9BX69 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARD6Q9BX69 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CARD6Q9BX69 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CARD6Q9BX69 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CARD6Q9BX69 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARD6Q9BX69 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CARD6Q9BX69 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARD6Q9BX69 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARD6Q9BX69 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARD6Q9BX69 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CARD6Q9BX69 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARD6Q9BX69 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARD6Q9BX69 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARD6Q9BX69 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CARD6Q9BX69 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARD6Q9BX69 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARD6Q9BX69 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CARD6Q9BX69 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARD6Q9BX69 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARD6Q9BX69 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARD6Q9BX69 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARD6Q9BX69 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARD6Q9BX69 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CARD6Q9BX69 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARD6Q9BX69 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARD6Q9BX69 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARD6Q9BX69 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CARD6Q9BX69 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARD6Q9BX69 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CARD6Q9BX69 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CARD6Q9BX69 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CARD6Q9BX69 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CARD6Q9BX69 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CARD6Q9BX69 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARD6Q9BX69 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CARD6Q9BX69 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARD6Q9BX69 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARD6Q9BX69 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARD6Q9BX69 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARD6Q9BX69 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARD6Q9BX69 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARD6Q9BX69 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARD6Q9BX69 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARD6Q9BX69 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARD6Q9BX69 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARD6Q9BX69 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARD6Q9BX69 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARD6Q9BX69 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CARD6Q9BX69 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARD6Q9BX69 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARD6Q9BX69 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARD6Q9BX69 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CARD6Q9BX69 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARD6Q9BX69 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARD6Q9BX69 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CARD6Q9BX69 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CARD6Q9BX69 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CARD6Q9BX69 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CARD6Q9BX69 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARD6Q9BX69 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARD6Q9BX69 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARD6Q9BX69 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARD6Q9BX69 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARD6Q9BX69 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CARD6Q9BX69 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARD6Q9BX69 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARD6Q9BX69 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARD6Q9BX69 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARD6Q9BX69 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARD6Q9BX69 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms