Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWM5

ZNF416, Zinc finger protein 416, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF416Q9BWM5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF416Q9BWM5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF416Q9BWM5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF416Q9BWM5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF416Q9BWM5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF416Q9BWM5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF416Q9BWM5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF416Q9BWM5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF416Q9BWM5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF416Q9BWM5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF416Q9BWM5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF416Q9BWM5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF416Q9BWM5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF416Q9BWM5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF416Q9BWM5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF416Q9BWM5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF416Q9BWM5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF416Q9BWM5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF416Q9BWM5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF416Q9BWM5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF416Q9BWM5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF416Q9BWM5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF416Q9BWM5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF416Q9BWM5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF416Q9BWM5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF416Q9BWM5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF416Q9BWM5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF416Q9BWM5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF416Q9BWM5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF416Q9BWM5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF416Q9BWM5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF416Q9BWM5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF416Q9BWM5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF416Q9BWM5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF416Q9BWM5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF416Q9BWM5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF416Q9BWM5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF416Q9BWM5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF416Q9BWM5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF416Q9BWM5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF416Q9BWM5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF416Q9BWM5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF416Q9BWM5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF416Q9BWM5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF416Q9BWM5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF416Q9BWM5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF416Q9BWM5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF416Q9BWM5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF416Q9BWM5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF416Q9BWM5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF416Q9BWM5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF416Q9BWM5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF416Q9BWM5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF416Q9BWM5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF416Q9BWM5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF416Q9BWM5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF416Q9BWM5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF416Q9BWM5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF416Q9BWM5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF416Q9BWM5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF416Q9BWM5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF416Q9BWM5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF416Q9BWM5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF416Q9BWM5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF416Q9BWM5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF416Q9BWM5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF416Q9BWM5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF416Q9BWM5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF416Q9BWM5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF416Q9BWM5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF416Q9BWM5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF416Q9BWM5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF416Q9BWM5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF416Q9BWM5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF416Q9BWM5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF416Q9BWM5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF416Q9BWM5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF416Q9BWM5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF416Q9BWM5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF416Q9BWM5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF416Q9BWM5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF416Q9BWM5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF416Q9BWM5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF416Q9BWM5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF416Q9BWM5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF416Q9BWM5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF416Q9BWM5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF416Q9BWM5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF416Q9BWM5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF416Q9BWM5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF416Q9BWM5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF416Q9BWM5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF416Q9BWM5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF416Q9BWM5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF416Q9BWM5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF416Q9BWM5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF416Q9BWM5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF416Q9BWM5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF416Q9BWM5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF416Q9BWM5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms