Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL4

SELENOO, Selenoprotein O, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOOQ9BVL4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SELENOOQ9BVL4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SELENOOQ9BVL4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SELENOOQ9BVL4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SELENOOQ9BVL4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SELENOOQ9BVL4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SELENOOQ9BVL4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SELENOOQ9BVL4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SELENOOQ9BVL4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SELENOOQ9BVL4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SELENOOQ9BVL4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SELENOOQ9BVL4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SELENOOQ9BVL4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SELENOOQ9BVL4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SELENOOQ9BVL4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SELENOOQ9BVL4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SELENOOQ9BVL4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SELENOOQ9BVL4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SELENOOQ9BVL4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SELENOOQ9BVL4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SELENOOQ9BVL4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SELENOOQ9BVL4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SELENOOQ9BVL4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SELENOOQ9BVL4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SELENOOQ9BVL4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SELENOOQ9BVL4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SELENOOQ9BVL4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SELENOOQ9BVL4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SELENOOQ9BVL4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SELENOOQ9BVL4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SELENOOQ9BVL4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SELENOOQ9BVL4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SELENOOQ9BVL4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SELENOOQ9BVL4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SELENOOQ9BVL4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SELENOOQ9BVL4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SELENOOQ9BVL4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SELENOOQ9BVL4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SELENOOQ9BVL4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SELENOOQ9BVL4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SELENOOQ9BVL4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SELENOOQ9BVL4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SELENOOQ9BVL4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SELENOOQ9BVL4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SELENOOQ9BVL4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SELENOOQ9BVL4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SELENOOQ9BVL4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SELENOOQ9BVL4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SELENOOQ9BVL4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SELENOOQ9BVL4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SELENOOQ9BVL4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SELENOOQ9BVL4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SELENOOQ9BVL4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SELENOOQ9BVL4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SELENOOQ9BVL4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SELENOOQ9BVL4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SELENOOQ9BVL4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SELENOOQ9BVL4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SELENOOQ9BVL4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SELENOOQ9BVL4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SELENOOQ9BVL4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SELENOOQ9BVL4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SELENOOQ9BVL4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SELENOOQ9BVL4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SELENOOQ9BVL4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SELENOOQ9BVL4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SELENOOQ9BVL4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SELENOOQ9BVL4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SELENOOQ9BVL4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SELENOOQ9BVL4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SELENOOQ9BVL4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SELENOOQ9BVL4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SELENOOQ9BVL4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SELENOOQ9BVL4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SELENOOQ9BVL4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SELENOOQ9BVL4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SELENOOQ9BVL4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SELENOOQ9BVL4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SELENOOQ9BVL4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SELENOOQ9BVL4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SELENOOQ9BVL4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SELENOOQ9BVL4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SELENOOQ9BVL4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SELENOOQ9BVL4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SELENOOQ9BVL4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SELENOOQ9BVL4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SELENOOQ9BVL4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SELENOOQ9BVL4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SELENOOQ9BVL4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SELENOOQ9BVL4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SELENOOQ9BVL4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SELENOOQ9BVL4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SELENOOQ9BVL4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SELENOOQ9BVL4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SELENOOQ9BVL4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SELENOOQ9BVL4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SELENOOQ9BVL4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SELENOOQ9BVL4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SELENOOQ9BVL4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SELENOOQ9BVL4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms