Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM43Q9BTV4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM43Q9BTV4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM43Q9BTV4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM43Q9BTV4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM43Q9BTV4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM43Q9BTV4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM43Q9BTV4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM43Q9BTV4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM43Q9BTV4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM43Q9BTV4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM43Q9BTV4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM43Q9BTV4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM43Q9BTV4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM43Q9BTV4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM43Q9BTV4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM43Q9BTV4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM43Q9BTV4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM43Q9BTV4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM43Q9BTV4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM43Q9BTV4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM43Q9BTV4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM43Q9BTV4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM43Q9BTV4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM43Q9BTV4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM43Q9BTV4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM43Q9BTV4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM43Q9BTV4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM43Q9BTV4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM43Q9BTV4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM43Q9BTV4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM43Q9BTV4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM43Q9BTV4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM43Q9BTV4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM43Q9BTV4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM43Q9BTV4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM43Q9BTV4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM43Q9BTV4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM43Q9BTV4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM43Q9BTV4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM43Q9BTV4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM43Q9BTV4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM43Q9BTV4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM43Q9BTV4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM43Q9BTV4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM43Q9BTV4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM43Q9BTV4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM43Q9BTV4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM43Q9BTV4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM43Q9BTV4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM43Q9BTV4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM43Q9BTV4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM43Q9BTV4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM43Q9BTV4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM43Q9BTV4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM43Q9BTV4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM43Q9BTV4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM43Q9BTV4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM43Q9BTV4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM43Q9BTV4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM43Q9BTV4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM43Q9BTV4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM43Q9BTV4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM43Q9BTV4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM43Q9BTV4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM43Q9BTV4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM43Q9BTV4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMEM43Q9BTV4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM43Q9BTV4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM43Q9BTV4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM43Q9BTV4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM43Q9BTV4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM43Q9BTV4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM43Q9BTV4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM43Q9BTV4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM43Q9BTV4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM43Q9BTV4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM43Q9BTV4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM43Q9BTV4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM43Q9BTV4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM43Q9BTV4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM43Q9BTV4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM43Q9BTV4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM43Q9BTV4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM43Q9BTV4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM43Q9BTV4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM43Q9BTV4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM43Q9BTV4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM43Q9BTV4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM43Q9BTV4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM43Q9BTV4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM43Q9BTV4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM43Q9BTV4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM43Q9BTV4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM43Q9BTV4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM43Q9BTV4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM43Q9BTV4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM43Q9BTV4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM43Q9BTV4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM43Q9BTV4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms