Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT3Q9BQG1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT3Q9BQG1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT3Q9BQG1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYT3Q9BQG1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT3Q9BQG1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT3Q9BQG1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYT3Q9BQG1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT3Q9BQG1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT3Q9BQG1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT3Q9BQG1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT3Q9BQG1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYT3Q9BQG1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT3Q9BQG1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYT3Q9BQG1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT3Q9BQG1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT3Q9BQG1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYT3Q9BQG1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYT3Q9BQG1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT3Q9BQG1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT3Q9BQG1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT3Q9BQG1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYT3Q9BQG1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT3Q9BQG1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT3Q9BQG1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT3Q9BQG1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT3Q9BQG1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT3Q9BQG1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT3Q9BQG1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT3Q9BQG1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT3Q9BQG1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT3Q9BQG1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT3Q9BQG1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT3Q9BQG1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT3Q9BQG1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT3Q9BQG1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT3Q9BQG1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT3Q9BQG1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT3Q9BQG1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT3Q9BQG1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT3Q9BQG1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT3Q9BQG1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT3Q9BQG1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT3Q9BQG1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT3Q9BQG1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT3Q9BQG1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT3Q9BQG1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT3Q9BQG1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT3Q9BQG1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT3Q9BQG1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT3Q9BQG1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT3Q9BQG1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT3Q9BQG1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT3Q9BQG1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT3Q9BQG1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT3Q9BQG1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT3Q9BQG1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT3Q9BQG1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT3Q9BQG1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT3Q9BQG1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT3Q9BQG1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT3Q9BQG1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYT3Q9BQG1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT3Q9BQG1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT3Q9BQG1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT3Q9BQG1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT3Q9BQG1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT3Q9BQG1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT3Q9BQG1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT3Q9BQG1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT3Q9BQG1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT3Q9BQG1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT3Q9BQG1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT3Q9BQG1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT3Q9BQG1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT3Q9BQG1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT3Q9BQG1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT3Q9BQG1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT3Q9BQG1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT3Q9BQG1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT3Q9BQG1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT3Q9BQG1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT3Q9BQG1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT3Q9BQG1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT3Q9BQG1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT3Q9BQG1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT3Q9BQG1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT3Q9BQG1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT3Q9BQG1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT3Q9BQG1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT3Q9BQG1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT3Q9BQG1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT3Q9BQG1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT3Q9BQG1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT3Q9BQG1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT3Q9BQG1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT3Q9BQG1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT3Q9BQG1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT3Q9BQG1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT3Q9BQG1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms