Protein–RNA interactions for Protein: Q99884

SLC6A7, Sodium-dependent proline transporter, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A7Q99884 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A7Q99884 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A7Q99884 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC6A7Q99884 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC6A7Q99884 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A7Q99884 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A7Q99884 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC6A7Q99884 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A7Q99884 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A7Q99884 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC6A7Q99884 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A7Q99884 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC6A7Q99884 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A7Q99884 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A7Q99884 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A7Q99884 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A7Q99884 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC6A7Q99884 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A7Q99884 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A7Q99884 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A7Q99884 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A7Q99884 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A7Q99884 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A7Q99884 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A7Q99884 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A7Q99884 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A7Q99884 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A7Q99884 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A7Q99884 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A7Q99884 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A7Q99884 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A7Q99884 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A7Q99884 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A7Q99884 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A7Q99884 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A7Q99884 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A7Q99884 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A7Q99884 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A7Q99884 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A7Q99884 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A7Q99884 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A7Q99884 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A7Q99884 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A7Q99884 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A7Q99884 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A7Q99884 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A7Q99884 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A7Q99884 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A7Q99884 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A7Q99884 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A7Q99884 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A7Q99884 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A7Q99884 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A7Q99884 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A7Q99884 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A7Q99884 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A7Q99884 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A7Q99884 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A7Q99884 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A7Q99884 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A7Q99884 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A7Q99884 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A7Q99884 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A7Q99884 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A7Q99884 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A7Q99884 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A7Q99884 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A7Q99884 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A7Q99884 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A7Q99884 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A7Q99884 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A7Q99884 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A7Q99884 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A7Q99884 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A7Q99884 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A7Q99884 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A7Q99884 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A7Q99884 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A7Q99884 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A7Q99884 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A7Q99884 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A7Q99884 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A7Q99884 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A7Q99884 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A7Q99884 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A7Q99884 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A7Q99884 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A7Q99884 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A7Q99884 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A7Q99884 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A7Q99884 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A7Q99884 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A7Q99884 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A7Q99884 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A7Q99884 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A7Q99884 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A7Q99884 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A7Q99884 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A7Q99884 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A7Q99884 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms