Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARID3AQ99856 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARID3AQ99856 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARID3AQ99856 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARID3AQ99856 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARID3AQ99856 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARID3AQ99856 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARID3AQ99856 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARID3AQ99856 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARID3AQ99856 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARID3AQ99856 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARID3AQ99856 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3AQ99856 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3AQ99856 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3AQ99856 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3AQ99856 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARID3AQ99856 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARID3AQ99856 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARID3AQ99856 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARID3AQ99856 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARID3AQ99856 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARID3AQ99856 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARID3AQ99856 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARID3AQ99856 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARID3AQ99856 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARID3AQ99856 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARID3AQ99856 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARID3AQ99856 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARID3AQ99856 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARID3AQ99856 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID3AQ99856 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID3AQ99856 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARID3AQ99856 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID3AQ99856 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID3AQ99856 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID3AQ99856 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID3AQ99856 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID3AQ99856 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARID3AQ99856 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID3AQ99856 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID3AQ99856 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARID3AQ99856 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ARID3AQ99856 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARID3AQ99856 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ARID3AQ99856 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID3AQ99856 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARID3AQ99856 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARID3AQ99856 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARID3AQ99856 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARID3AQ99856 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3AQ99856 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3AQ99856 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3AQ99856 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARID3AQ99856 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID3AQ99856 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARID3AQ99856 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARID3AQ99856 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARID3AQ99856 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARID3AQ99856 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ARID3AQ99856 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARID3AQ99856 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARID3AQ99856 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARID3AQ99856 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ARID3AQ99856 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARID3AQ99856 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARID3AQ99856 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARID3AQ99856 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARID3AQ99856 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARID3AQ99856 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARID3AQ99856 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARID3AQ99856 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARID3AQ99856 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARID3AQ99856 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARID3AQ99856 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARID3AQ99856 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARID3AQ99856 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARID3AQ99856 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARID3AQ99856 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARID3AQ99856 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARID3AQ99856 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARID3AQ99856 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARID3AQ99856 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARID3AQ99856 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARID3AQ99856 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ARID3AQ99856 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARID3AQ99856 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARID3AQ99856 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARID3AQ99856 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARID3AQ99856 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARID3AQ99856 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARID3AQ99856 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARID3AQ99856 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARID3AQ99856 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ARID3AQ99856 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARID3AQ99856 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ARID3AQ99856 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID3AQ99856 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID3AQ99856 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID3AQ99856 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID3AQ99856 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms