Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PFDN5Q99471 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PFDN5Q99471 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PFDN5Q99471 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PFDN5Q99471 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PFDN5Q99471 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PFDN5Q99471 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PFDN5Q99471 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PFDN5Q99471 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PFDN5Q99471 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PFDN5Q99471 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PFDN5Q99471 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PFDN5Q99471 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PFDN5Q99471 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PFDN5Q99471 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PFDN5Q99471 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PFDN5Q99471 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PFDN5Q99471 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PFDN5Q99471 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PFDN5Q99471 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PFDN5Q99471 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PFDN5Q99471 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PFDN5Q99471 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PFDN5Q99471 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PFDN5Q99471 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PFDN5Q99471 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PFDN5Q99471 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PFDN5Q99471 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PFDN5Q99471 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PFDN5Q99471 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PFDN5Q99471 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PFDN5Q99471 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PFDN5Q99471 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PFDN5Q99471 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PFDN5Q99471 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PFDN5Q99471 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PFDN5Q99471 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PFDN5Q99471 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PFDN5Q99471 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PFDN5Q99471 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PFDN5Q99471 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PFDN5Q99471 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PFDN5Q99471 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PFDN5Q99471 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PFDN5Q99471 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PFDN5Q99471 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PFDN5Q99471 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PFDN5Q99471 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PFDN5Q99471 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PFDN5Q99471 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PFDN5Q99471 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PFDN5Q99471 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PFDN5Q99471 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PFDN5Q99471 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PFDN5Q99471 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PFDN5Q99471 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PFDN5Q99471 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PFDN5Q99471 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PFDN5Q99471 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PFDN5Q99471 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PFDN5Q99471 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PFDN5Q99471 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PFDN5Q99471 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PFDN5Q99471 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PFDN5Q99471 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PFDN5Q99471 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PFDN5Q99471 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PFDN5Q99471 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PFDN5Q99471 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PFDN5Q99471 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PFDN5Q99471 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PFDN5Q99471 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PFDN5Q99471 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PFDN5Q99471 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PFDN5Q99471 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PFDN5Q99471 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PFDN5Q99471 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PFDN5Q99471 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PFDN5Q99471 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PFDN5Q99471 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PFDN5Q99471 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PFDN5Q99471 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PFDN5Q99471 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PFDN5Q99471 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PFDN5Q99471 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PFDN5Q99471 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PFDN5Q99471 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PFDN5Q99471 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PFDN5Q99471 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PFDN5Q99471 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PFDN5Q99471 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PFDN5Q99471 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PFDN5Q99471 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PFDN5Q99471 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PFDN5Q99471 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PFDN5Q99471 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PFDN5Q99471 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PFDN5Q99471 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PFDN5Q99471 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PFDN5Q99471 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms