Protein–RNA interactions for Protein: Q96T54

KCNK17, Potassium channel subfamily K member 17, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK17Q96T54 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNK17Q96T54 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNK17Q96T54 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNK17Q96T54 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNK17Q96T54 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNK17Q96T54 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNK17Q96T54 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNK17Q96T54 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNK17Q96T54 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNK17Q96T54 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNK17Q96T54 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNK17Q96T54 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNK17Q96T54 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNK17Q96T54 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNK17Q96T54 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNK17Q96T54 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNK17Q96T54 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNK17Q96T54 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms