Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CRAMP1Q96RY5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CRAMP1Q96RY5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CRAMP1Q96RY5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CRAMP1Q96RY5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CRAMP1Q96RY5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CRAMP1Q96RY5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CRAMP1Q96RY5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CRAMP1Q96RY5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CRAMP1Q96RY5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CRAMP1Q96RY5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CRAMP1Q96RY5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CRAMP1Q96RY5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CRAMP1Q96RY5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CRAMP1Q96RY5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CRAMP1Q96RY5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CRAMP1Q96RY5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CRAMP1Q96RY5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CRAMP1Q96RY5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CRAMP1Q96RY5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CRAMP1Q96RY5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CRAMP1Q96RY5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CRAMP1Q96RY5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CRAMP1Q96RY5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CRAMP1Q96RY5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CRAMP1Q96RY5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CRAMP1Q96RY5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CRAMP1Q96RY5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CRAMP1Q96RY5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CRAMP1Q96RY5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CRAMP1Q96RY5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CRAMP1Q96RY5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CRAMP1Q96RY5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CRAMP1Q96RY5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CRAMP1Q96RY5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CRAMP1Q96RY5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CRAMP1Q96RY5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CRAMP1Q96RY5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CRAMP1Q96RY5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CRAMP1Q96RY5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CRAMP1Q96RY5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CRAMP1Q96RY5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CRAMP1Q96RY5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CRAMP1Q96RY5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CRAMP1Q96RY5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CRAMP1Q96RY5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CRAMP1Q96RY5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CRAMP1Q96RY5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CRAMP1Q96RY5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CRAMP1Q96RY5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CRAMP1Q96RY5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CRAMP1Q96RY5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CRAMP1Q96RY5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CRAMP1Q96RY5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CRAMP1Q96RY5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CRAMP1Q96RY5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CRAMP1Q96RY5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CRAMP1Q96RY5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CRAMP1Q96RY5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CRAMP1Q96RY5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CRAMP1Q96RY5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CRAMP1Q96RY5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CRAMP1Q96RY5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CRAMP1Q96RY5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CRAMP1Q96RY5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CRAMP1Q96RY5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CRAMP1Q96RY5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CRAMP1Q96RY5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CRAMP1Q96RY5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CRAMP1Q96RY5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CRAMP1Q96RY5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CRAMP1Q96RY5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CRAMP1Q96RY5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CRAMP1Q96RY5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
CRAMP1Q96RY5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CRAMP1Q96RY5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CRAMP1Q96RY5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
CRAMP1Q96RY5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CRAMP1Q96RY5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CRAMP1Q96RY5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CRAMP1Q96RY5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CRAMP1Q96RY5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CRAMP1Q96RY5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CRAMP1Q96RY5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CRAMP1Q96RY5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CRAMP1Q96RY5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CRAMP1Q96RY5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CRAMP1Q96RY5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CRAMP1Q96RY5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CRAMP1Q96RY5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CRAMP1Q96RY5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CRAMP1Q96RY5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CRAMP1Q96RY5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CRAMP1Q96RY5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CRAMP1Q96RY5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CRAMP1Q96RY5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CRAMP1Q96RY5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CRAMP1Q96RY5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CRAMP1Q96RY5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CRAMP1Q96RY5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms