Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB3IPQ96QF0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB3IPQ96QF0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB3IPQ96QF0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB3IPQ96QF0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB3IPQ96QF0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB3IPQ96QF0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB3IPQ96QF0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB3IPQ96QF0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB3IPQ96QF0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB3IPQ96QF0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB3IPQ96QF0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB3IPQ96QF0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB3IPQ96QF0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB3IPQ96QF0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB3IPQ96QF0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB3IPQ96QF0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB3IPQ96QF0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB3IPQ96QF0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB3IPQ96QF0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB3IPQ96QF0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB3IPQ96QF0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB3IPQ96QF0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB3IPQ96QF0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB3IPQ96QF0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB3IPQ96QF0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB3IPQ96QF0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB3IPQ96QF0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB3IPQ96QF0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB3IPQ96QF0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB3IPQ96QF0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB3IPQ96QF0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB3IPQ96QF0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB3IPQ96QF0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB3IPQ96QF0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB3IPQ96QF0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB3IPQ96QF0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB3IPQ96QF0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAB3IPQ96QF0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB3IPQ96QF0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB3IPQ96QF0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB3IPQ96QF0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB3IPQ96QF0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB3IPQ96QF0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB3IPQ96QF0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3IPQ96QF0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3IPQ96QF0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB3IPQ96QF0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB3IPQ96QF0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB3IPQ96QF0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB3IPQ96QF0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAB3IPQ96QF0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB3IPQ96QF0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB3IPQ96QF0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB3IPQ96QF0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB3IPQ96QF0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB3IPQ96QF0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB3IPQ96QF0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB3IPQ96QF0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB3IPQ96QF0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB3IPQ96QF0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB3IPQ96QF0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB3IPQ96QF0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB3IPQ96QF0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RAB3IPQ96QF0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB3IPQ96QF0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB3IPQ96QF0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB3IPQ96QF0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB3IPQ96QF0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB3IPQ96QF0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB3IPQ96QF0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB3IPQ96QF0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB3IPQ96QF0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB3IPQ96QF0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB3IPQ96QF0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB3IPQ96QF0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB3IPQ96QF0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB3IPQ96QF0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB3IPQ96QF0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB3IPQ96QF0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB3IPQ96QF0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB3IPQ96QF0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB3IPQ96QF0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB3IPQ96QF0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB3IPQ96QF0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB3IPQ96QF0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB3IPQ96QF0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB3IPQ96QF0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB3IPQ96QF0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB3IPQ96QF0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB3IPQ96QF0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB3IPQ96QF0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB3IPQ96QF0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB3IPQ96QF0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB3IPQ96QF0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB3IPQ96QF0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB3IPQ96QF0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB3IPQ96QF0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAB3IPQ96QF0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB3IPQ96QF0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms