Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRNT1Q96Q11 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRNT1Q96Q11 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRNT1Q96Q11 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRNT1Q96Q11 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRNT1Q96Q11 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRNT1Q96Q11 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRNT1Q96Q11 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRNT1Q96Q11 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRNT1Q96Q11 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRNT1Q96Q11 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRNT1Q96Q11 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRNT1Q96Q11 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRNT1Q96Q11 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRNT1Q96Q11 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRNT1Q96Q11 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRNT1Q96Q11 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRNT1Q96Q11 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRNT1Q96Q11 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRNT1Q96Q11 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRNT1Q96Q11 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRNT1Q96Q11 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRNT1Q96Q11 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRNT1Q96Q11 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRNT1Q96Q11 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRNT1Q96Q11 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRNT1Q96Q11 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRNT1Q96Q11 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRNT1Q96Q11 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRNT1Q96Q11 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRNT1Q96Q11 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRNT1Q96Q11 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRNT1Q96Q11 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRNT1Q96Q11 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRNT1Q96Q11 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRNT1Q96Q11 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRNT1Q96Q11 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRNT1Q96Q11 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRNT1Q96Q11 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRNT1Q96Q11 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRNT1Q96Q11 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRNT1Q96Q11 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRNT1Q96Q11 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRNT1Q96Q11 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRNT1Q96Q11 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRNT1Q96Q11 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRNT1Q96Q11 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRNT1Q96Q11 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRNT1Q96Q11 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRNT1Q96Q11 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRNT1Q96Q11 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRNT1Q96Q11 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRNT1Q96Q11 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRNT1Q96Q11 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNT1Q96Q11 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNT1Q96Q11 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNT1Q96Q11 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNT1Q96Q11 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNT1Q96Q11 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNT1Q96Q11 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRNT1Q96Q11 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRNT1Q96Q11 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRNT1Q96Q11 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRNT1Q96Q11 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRNT1Q96Q11 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRNT1Q96Q11 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRNT1Q96Q11 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRNT1Q96Q11 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRNT1Q96Q11 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRNT1Q96Q11 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRNT1Q96Q11 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRNT1Q96Q11 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRNT1Q96Q11 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRNT1Q96Q11 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRNT1Q96Q11 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRNT1Q96Q11 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRNT1Q96Q11 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRNT1Q96Q11 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRNT1Q96Q11 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRNT1Q96Q11 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRNT1Q96Q11 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRNT1Q96Q11 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRNT1Q96Q11 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRNT1Q96Q11 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRNT1Q96Q11 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRNT1Q96Q11 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRNT1Q96Q11 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRNT1Q96Q11 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRNT1Q96Q11 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRNT1Q96Q11 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRNT1Q96Q11 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRNT1Q96Q11 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRNT1Q96Q11 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRNT1Q96Q11 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRNT1Q96Q11 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRNT1Q96Q11 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRNT1Q96Q11 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRNT1Q96Q11 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRNT1Q96Q11 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRNT1Q96Q11 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
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