Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSNARE1Q96NA8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSNARE1Q96NA8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSNARE1Q96NA8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSNARE1Q96NA8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSNARE1Q96NA8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSNARE1Q96NA8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSNARE1Q96NA8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSNARE1Q96NA8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSNARE1Q96NA8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSNARE1Q96NA8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSNARE1Q96NA8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSNARE1Q96NA8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSNARE1Q96NA8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSNARE1Q96NA8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSNARE1Q96NA8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSNARE1Q96NA8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSNARE1Q96NA8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSNARE1Q96NA8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSNARE1Q96NA8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TSNARE1Q96NA8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSNARE1Q96NA8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSNARE1Q96NA8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSNARE1Q96NA8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSNARE1Q96NA8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSNARE1Q96NA8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSNARE1Q96NA8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSNARE1Q96NA8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSNARE1Q96NA8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSNARE1Q96NA8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TSNARE1Q96NA8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSNARE1Q96NA8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSNARE1Q96NA8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSNARE1Q96NA8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSNARE1Q96NA8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSNARE1Q96NA8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSNARE1Q96NA8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
TSNARE1Q96NA8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSNARE1Q96NA8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSNARE1Q96NA8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSNARE1Q96NA8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSNARE1Q96NA8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSNARE1Q96NA8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSNARE1Q96NA8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSNARE1Q96NA8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSNARE1Q96NA8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSNARE1Q96NA8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSNARE1Q96NA8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TSNARE1Q96NA8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TSNARE1Q96NA8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TSNARE1Q96NA8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TSNARE1Q96NA8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TSNARE1Q96NA8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSNARE1Q96NA8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSNARE1Q96NA8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSNARE1Q96NA8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSNARE1Q96NA8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSNARE1Q96NA8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSNARE1Q96NA8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSNARE1Q96NA8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSNARE1Q96NA8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSNARE1Q96NA8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TSNARE1Q96NA8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSNARE1Q96NA8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSNARE1Q96NA8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSNARE1Q96NA8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSNARE1Q96NA8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSNARE1Q96NA8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSNARE1Q96NA8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSNARE1Q96NA8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSNARE1Q96NA8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSNARE1Q96NA8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSNARE1Q96NA8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSNARE1Q96NA8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSNARE1Q96NA8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TSNARE1Q96NA8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSNARE1Q96NA8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TSNARE1Q96NA8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSNARE1Q96NA8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSNARE1Q96NA8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSNARE1Q96NA8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSNARE1Q96NA8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSNARE1Q96NA8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSNARE1Q96NA8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSNARE1Q96NA8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TSNARE1Q96NA8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSNARE1Q96NA8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSNARE1Q96NA8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSNARE1Q96NA8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSNARE1Q96NA8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSNARE1Q96NA8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSNARE1Q96NA8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSNARE1Q96NA8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSNARE1Q96NA8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TSNARE1Q96NA8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSNARE1Q96NA8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSNARE1Q96NA8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSNARE1Q96NA8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSNARE1Q96NA8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSNARE1Q96NA8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms