Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP57Q96MR6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP57Q96MR6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP57Q96MR6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP57Q96MR6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP57Q96MR6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP57Q96MR6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP57Q96MR6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP57Q96MR6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP57Q96MR6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP57Q96MR6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP57Q96MR6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP57Q96MR6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP57Q96MR6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP57Q96MR6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP57Q96MR6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP57Q96MR6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP57Q96MR6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP57Q96MR6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP57Q96MR6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP57Q96MR6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP57Q96MR6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP57Q96MR6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP57Q96MR6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP57Q96MR6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP57Q96MR6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP57Q96MR6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP57Q96MR6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP57Q96MR6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CFAP57Q96MR6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP57Q96MR6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP57Q96MR6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP57Q96MR6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP57Q96MR6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP57Q96MR6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP57Q96MR6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP57Q96MR6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP57Q96MR6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP57Q96MR6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP57Q96MR6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP57Q96MR6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP57Q96MR6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP57Q96MR6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP57Q96MR6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP57Q96MR6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP57Q96MR6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP57Q96MR6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP57Q96MR6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP57Q96MR6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP57Q96MR6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP57Q96MR6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP57Q96MR6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP57Q96MR6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP57Q96MR6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP57Q96MR6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP57Q96MR6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP57Q96MR6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP57Q96MR6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP57Q96MR6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP57Q96MR6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP57Q96MR6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP57Q96MR6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP57Q96MR6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP57Q96MR6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP57Q96MR6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP57Q96MR6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP57Q96MR6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP57Q96MR6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP57Q96MR6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP57Q96MR6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP57Q96MR6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CFAP57Q96MR6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CFAP57Q96MR6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP57Q96MR6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP57Q96MR6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP57Q96MR6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP57Q96MR6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP57Q96MR6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP57Q96MR6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP57Q96MR6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP57Q96MR6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP57Q96MR6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP57Q96MR6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP57Q96MR6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP57Q96MR6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP57Q96MR6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP57Q96MR6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP57Q96MR6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP57Q96MR6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP57Q96MR6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP57Q96MR6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP57Q96MR6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP57Q96MR6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP57Q96MR6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP57Q96MR6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP57Q96MR6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFAP57Q96MR6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP57Q96MR6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP57Q96MR6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP57Q96MR6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms