Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC114Q96M63 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC114Q96M63 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC114Q96M63 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC114Q96M63 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC114Q96M63 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC114Q96M63 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC114Q96M63 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC114Q96M63 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC114Q96M63 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC114Q96M63 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC114Q96M63 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC114Q96M63 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC114Q96M63 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC114Q96M63 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC114Q96M63 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC114Q96M63 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC114Q96M63 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC114Q96M63 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC114Q96M63 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC114Q96M63 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC114Q96M63 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC114Q96M63 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC114Q96M63 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC114Q96M63 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC114Q96M63 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC114Q96M63 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC114Q96M63 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC114Q96M63 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC114Q96M63 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC114Q96M63 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC114Q96M63 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC114Q96M63 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC114Q96M63 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC114Q96M63 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC114Q96M63 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC114Q96M63 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC114Q96M63 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC114Q96M63 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC114Q96M63 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC114Q96M63 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC114Q96M63 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC114Q96M63 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC114Q96M63 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC114Q96M63 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC114Q96M63 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC114Q96M63 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC114Q96M63 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC114Q96M63 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC114Q96M63 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC114Q96M63 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC114Q96M63 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC114Q96M63 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC114Q96M63 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC114Q96M63 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC114Q96M63 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC114Q96M63 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC114Q96M63 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC114Q96M63 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC114Q96M63 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC114Q96M63 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC114Q96M63 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC114Q96M63 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC114Q96M63 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC114Q96M63 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC114Q96M63 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC114Q96M63 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC114Q96M63 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC114Q96M63 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC114Q96M63 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC114Q96M63 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC114Q96M63 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC114Q96M63 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC114Q96M63 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC114Q96M63 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC114Q96M63 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC114Q96M63 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC114Q96M63 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC114Q96M63 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC114Q96M63 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC114Q96M63 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC114Q96M63 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC114Q96M63 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC114Q96M63 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC114Q96M63 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC114Q96M63 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC114Q96M63 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC114Q96M63 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC114Q96M63 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC114Q96M63 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC114Q96M63 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC114Q96M63 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC114Q96M63 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC114Q96M63 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC114Q96M63 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC114Q96M63 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC114Q96M63 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC114Q96M63 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC114Q96M63 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC114Q96M63 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms