Protein–RNA interactions for Protein: Q96LZ7

RMDN2, Regulator of microtubule dynamics protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN2Q96LZ7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RMDN2Q96LZ7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RMDN2Q96LZ7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RMDN2Q96LZ7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RMDN2Q96LZ7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RMDN2Q96LZ7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RMDN2Q96LZ7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RMDN2Q96LZ7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RMDN2Q96LZ7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RMDN2Q96LZ7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RMDN2Q96LZ7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RMDN2Q96LZ7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RMDN2Q96LZ7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RMDN2Q96LZ7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RMDN2Q96LZ7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RMDN2Q96LZ7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RMDN2Q96LZ7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RMDN2Q96LZ7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RMDN2Q96LZ7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RMDN2Q96LZ7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RMDN2Q96LZ7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RMDN2Q96LZ7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RMDN2Q96LZ7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RMDN2Q96LZ7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RMDN2Q96LZ7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RMDN2Q96LZ7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RMDN2Q96LZ7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RMDN2Q96LZ7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RMDN2Q96LZ7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RMDN2Q96LZ7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RMDN2Q96LZ7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RMDN2Q96LZ7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RMDN2Q96LZ7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RMDN2Q96LZ7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RMDN2Q96LZ7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RMDN2Q96LZ7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RMDN2Q96LZ7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RMDN2Q96LZ7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RMDN2Q96LZ7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RMDN2Q96LZ7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RMDN2Q96LZ7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RMDN2Q96LZ7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RMDN2Q96LZ7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RMDN2Q96LZ7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RMDN2Q96LZ7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RMDN2Q96LZ7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RMDN2Q96LZ7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RMDN2Q96LZ7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RMDN2Q96LZ7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RMDN2Q96LZ7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RMDN2Q96LZ7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RMDN2Q96LZ7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RMDN2Q96LZ7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RMDN2Q96LZ7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RMDN2Q96LZ7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RMDN2Q96LZ7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RMDN2Q96LZ7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RMDN2Q96LZ7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RMDN2Q96LZ7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RMDN2Q96LZ7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RMDN2Q96LZ7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RMDN2Q96LZ7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RMDN2Q96LZ7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RMDN2Q96LZ7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RMDN2Q96LZ7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RMDN2Q96LZ7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RMDN2Q96LZ7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RMDN2Q96LZ7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RMDN2Q96LZ7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RMDN2Q96LZ7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RMDN2Q96LZ7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RMDN2Q96LZ7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RMDN2Q96LZ7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RMDN2Q96LZ7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RMDN2Q96LZ7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RMDN2Q96LZ7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RMDN2Q96LZ7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RMDN2Q96LZ7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RMDN2Q96LZ7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RMDN2Q96LZ7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RMDN2Q96LZ7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RMDN2Q96LZ7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RMDN2Q96LZ7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RMDN2Q96LZ7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RMDN2Q96LZ7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RMDN2Q96LZ7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RMDN2Q96LZ7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RMDN2Q96LZ7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RMDN2Q96LZ7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RMDN2Q96LZ7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RMDN2Q96LZ7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RMDN2Q96LZ7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RMDN2Q96LZ7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RMDN2Q96LZ7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RMDN2Q96LZ7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RMDN2Q96LZ7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RMDN2Q96LZ7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RMDN2Q96LZ7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RMDN2Q96LZ7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RMDN2Q96LZ7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms