Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOLD1Q96LR9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOLD1Q96LR9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOLD1Q96LR9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOLD1Q96LR9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOLD1Q96LR9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOLD1Q96LR9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOLD1Q96LR9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOLD1Q96LR9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOLD1Q96LR9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
APOLD1Q96LR9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOLD1Q96LR9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOLD1Q96LR9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOLD1Q96LR9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOLD1Q96LR9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOLD1Q96LR9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOLD1Q96LR9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOLD1Q96LR9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOLD1Q96LR9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOLD1Q96LR9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOLD1Q96LR9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
APOLD1Q96LR9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
APOLD1Q96LR9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOLD1Q96LR9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOLD1Q96LR9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOLD1Q96LR9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOLD1Q96LR9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms