Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOLD1Q96LR9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOLD1Q96LR9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APOLD1Q96LR9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOLD1Q96LR9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOLD1Q96LR9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOLD1Q96LR9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOLD1Q96LR9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APOLD1Q96LR9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APOLD1Q96LR9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
APOLD1Q96LR9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOLD1Q96LR9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOLD1Q96LR9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOLD1Q96LR9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOLD1Q96LR9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOLD1Q96LR9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOLD1Q96LR9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOLD1Q96LR9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOLD1Q96LR9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOLD1Q96LR9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOLD1Q96LR9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOLD1Q96LR9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOLD1Q96LR9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOLD1Q96LR9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
APOLD1Q96LR9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOLD1Q96LR9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
APOLD1Q96LR9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOLD1Q96LR9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOLD1Q96LR9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOLD1Q96LR9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOLD1Q96LR9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms