Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC16BQ96JE7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC16BQ96JE7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC16BQ96JE7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC16BQ96JE7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC16BQ96JE7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC16BQ96JE7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC16BQ96JE7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC16BQ96JE7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC16BQ96JE7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC16BQ96JE7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC16BQ96JE7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC16BQ96JE7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC16BQ96JE7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC16BQ96JE7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC16BQ96JE7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC16BQ96JE7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC16BQ96JE7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC16BQ96JE7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC16BQ96JE7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC16BQ96JE7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC16BQ96JE7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC16BQ96JE7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC16BQ96JE7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC16BQ96JE7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC16BQ96JE7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC16BQ96JE7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC16BQ96JE7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC16BQ96JE7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC16BQ96JE7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC16BQ96JE7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC16BQ96JE7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC16BQ96JE7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC16BQ96JE7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC16BQ96JE7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC16BQ96JE7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC16BQ96JE7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC16BQ96JE7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC16BQ96JE7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC16BQ96JE7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEC16BQ96JE7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEC16BQ96JE7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEC16BQ96JE7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC16BQ96JE7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC16BQ96JE7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC16BQ96JE7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC16BQ96JE7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC16BQ96JE7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC16BQ96JE7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC16BQ96JE7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC16BQ96JE7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC16BQ96JE7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC16BQ96JE7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC16BQ96JE7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC16BQ96JE7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SEC16BQ96JE7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC16BQ96JE7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC16BQ96JE7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC16BQ96JE7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC16BQ96JE7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC16BQ96JE7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC16BQ96JE7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC16BQ96JE7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC16BQ96JE7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC16BQ96JE7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC16BQ96JE7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC16BQ96JE7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC16BQ96JE7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC16BQ96JE7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC16BQ96JE7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC16BQ96JE7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC16BQ96JE7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC16BQ96JE7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC16BQ96JE7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC16BQ96JE7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC16BQ96JE7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC16BQ96JE7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC16BQ96JE7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC16BQ96JE7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC16BQ96JE7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC16BQ96JE7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC16BQ96JE7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC16BQ96JE7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC16BQ96JE7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC16BQ96JE7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC16BQ96JE7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC16BQ96JE7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SEC16BQ96JE7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC16BQ96JE7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC16BQ96JE7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC16BQ96JE7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC16BQ96JE7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC16BQ96JE7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC16BQ96JE7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC16BQ96JE7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC16BQ96JE7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC16BQ96JE7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC16BQ96JE7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC16BQ96JE7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC16BQ96JE7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms