Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRIG1Q96JA1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRIG1Q96JA1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRIG1Q96JA1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRIG1Q96JA1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRIG1Q96JA1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRIG1Q96JA1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRIG1Q96JA1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRIG1Q96JA1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRIG1Q96JA1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRIG1Q96JA1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRIG1Q96JA1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRIG1Q96JA1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRIG1Q96JA1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRIG1Q96JA1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRIG1Q96JA1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRIG1Q96JA1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRIG1Q96JA1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRIG1Q96JA1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRIG1Q96JA1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRIG1Q96JA1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRIG1Q96JA1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRIG1Q96JA1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRIG1Q96JA1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRIG1Q96JA1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRIG1Q96JA1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LRIG1Q96JA1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRIG1Q96JA1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRIG1Q96JA1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRIG1Q96JA1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRIG1Q96JA1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRIG1Q96JA1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRIG1Q96JA1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRIG1Q96JA1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRIG1Q96JA1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRIG1Q96JA1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRIG1Q96JA1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRIG1Q96JA1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRIG1Q96JA1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRIG1Q96JA1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRIG1Q96JA1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRIG1Q96JA1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRIG1Q96JA1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRIG1Q96JA1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRIG1Q96JA1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRIG1Q96JA1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRIG1Q96JA1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRIG1Q96JA1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRIG1Q96JA1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRIG1Q96JA1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LRIG1Q96JA1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRIG1Q96JA1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRIG1Q96JA1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRIG1Q96JA1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRIG1Q96JA1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRIG1Q96JA1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRIG1Q96JA1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRIG1Q96JA1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRIG1Q96JA1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRIG1Q96JA1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRIG1Q96JA1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRIG1Q96JA1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRIG1Q96JA1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRIG1Q96JA1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRIG1Q96JA1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRIG1Q96JA1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRIG1Q96JA1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRIG1Q96JA1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRIG1Q96JA1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRIG1Q96JA1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRIG1Q96JA1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRIG1Q96JA1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRIG1Q96JA1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRIG1Q96JA1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRIG1Q96JA1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRIG1Q96JA1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRIG1Q96JA1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRIG1Q96JA1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LRIG1Q96JA1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRIG1Q96JA1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRIG1Q96JA1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRIG1Q96JA1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRIG1Q96JA1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRIG1Q96JA1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRIG1Q96JA1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRIG1Q96JA1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRIG1Q96JA1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRIG1Q96JA1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRIG1Q96JA1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRIG1Q96JA1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRIG1Q96JA1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRIG1Q96JA1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRIG1Q96JA1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRIG1Q96JA1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LRIG1Q96JA1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRIG1Q96JA1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRIG1Q96JA1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRIG1Q96JA1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRIG1Q96JA1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRIG1Q96JA1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms