Protein–RNA interactions for Protein: Q96J84

KIRREL1, Kin of IRRE-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL1Q96J84 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KIRREL1Q96J84 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIRREL1Q96J84 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KIRREL1Q96J84 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIRREL1Q96J84 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIRREL1Q96J84 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIRREL1Q96J84 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms