Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A3Q96HJ5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A3Q96HJ5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A3Q96HJ5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MS4A3Q96HJ5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MS4A3Q96HJ5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A3Q96HJ5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A3Q96HJ5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A3Q96HJ5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A3Q96HJ5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A3Q96HJ5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A3Q96HJ5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A3Q96HJ5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A3Q96HJ5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A3Q96HJ5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A3Q96HJ5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A3Q96HJ5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A3Q96HJ5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A3Q96HJ5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A3Q96HJ5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A3Q96HJ5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A3Q96HJ5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A3Q96HJ5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A3Q96HJ5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A3Q96HJ5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A3Q96HJ5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A3Q96HJ5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A3Q96HJ5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A3Q96HJ5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A3Q96HJ5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A3Q96HJ5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A3Q96HJ5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A3Q96HJ5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A3Q96HJ5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A3Q96HJ5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A3Q96HJ5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A3Q96HJ5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A3Q96HJ5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A3Q96HJ5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A3Q96HJ5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A3Q96HJ5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MS4A3Q96HJ5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MS4A3Q96HJ5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MS4A3Q96HJ5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MS4A3Q96HJ5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MS4A3Q96HJ5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MS4A3Q96HJ5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A3Q96HJ5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A3Q96HJ5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A3Q96HJ5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A3Q96HJ5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A3Q96HJ5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A3Q96HJ5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A3Q96HJ5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A3Q96HJ5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A3Q96HJ5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A3Q96HJ5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A3Q96HJ5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A3Q96HJ5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A3Q96HJ5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A3Q96HJ5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A3Q96HJ5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A3Q96HJ5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A3Q96HJ5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A3Q96HJ5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A3Q96HJ5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MS4A3Q96HJ5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A3Q96HJ5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A3Q96HJ5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A3Q96HJ5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A3Q96HJ5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A3Q96HJ5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A3Q96HJ5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A3Q96HJ5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A3Q96HJ5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A3Q96HJ5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A3Q96HJ5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A3Q96HJ5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A3Q96HJ5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A3Q96HJ5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A3Q96HJ5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A3Q96HJ5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MS4A3Q96HJ5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A3Q96HJ5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A3Q96HJ5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A3Q96HJ5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MS4A3Q96HJ5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MS4A3Q96HJ5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A3Q96HJ5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A3Q96HJ5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MS4A3Q96HJ5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A3Q96HJ5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A3Q96HJ5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A3Q96HJ5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A3Q96HJ5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A3Q96HJ5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A3Q96HJ5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A3Q96HJ5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A3Q96HJ5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A3Q96HJ5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms