Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFRP2Q96HF1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFRP2Q96HF1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFRP2Q96HF1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFRP2Q96HF1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFRP2Q96HF1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFRP2Q96HF1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFRP2Q96HF1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFRP2Q96HF1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFRP2Q96HF1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFRP2Q96HF1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFRP2Q96HF1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFRP2Q96HF1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFRP2Q96HF1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFRP2Q96HF1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFRP2Q96HF1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFRP2Q96HF1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFRP2Q96HF1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFRP2Q96HF1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFRP2Q96HF1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFRP2Q96HF1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFRP2Q96HF1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFRP2Q96HF1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFRP2Q96HF1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFRP2Q96HF1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFRP2Q96HF1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFRP2Q96HF1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP2Q96HF1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP2Q96HF1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP2Q96HF1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP2Q96HF1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFRP2Q96HF1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP2Q96HF1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFRP2Q96HF1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SFRP2Q96HF1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFRP2Q96HF1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFRP2Q96HF1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFRP2Q96HF1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFRP2Q96HF1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFRP2Q96HF1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFRP2Q96HF1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFRP2Q96HF1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFRP2Q96HF1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFRP2Q96HF1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFRP2Q96HF1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFRP2Q96HF1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SFRP2Q96HF1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFRP2Q96HF1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFRP2Q96HF1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFRP2Q96HF1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFRP2Q96HF1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFRP2Q96HF1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFRP2Q96HF1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFRP2Q96HF1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFRP2Q96HF1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFRP2Q96HF1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFRP2Q96HF1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFRP2Q96HF1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFRP2Q96HF1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFRP2Q96HF1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFRP2Q96HF1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFRP2Q96HF1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFRP2Q96HF1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFRP2Q96HF1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFRP2Q96HF1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFRP2Q96HF1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFRP2Q96HF1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFRP2Q96HF1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFRP2Q96HF1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFRP2Q96HF1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFRP2Q96HF1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFRP2Q96HF1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFRP2Q96HF1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFRP2Q96HF1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFRP2Q96HF1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFRP2Q96HF1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFRP2Q96HF1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFRP2Q96HF1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFRP2Q96HF1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFRP2Q96HF1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFRP2Q96HF1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFRP2Q96HF1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFRP2Q96HF1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFRP2Q96HF1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFRP2Q96HF1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFRP2Q96HF1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFRP2Q96HF1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFRP2Q96HF1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFRP2Q96HF1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFRP2Q96HF1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFRP2Q96HF1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFRP2Q96HF1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFRP2Q96HF1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFRP2Q96HF1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFRP2Q96HF1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFRP2Q96HF1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFRP2Q96HF1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFRP2Q96HF1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFRP2Q96HF1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFRP2Q96HF1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms