Protein–RNA interactions for Protein: Q96FX8

PERP, p53 apoptosis effector related to PMP-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERPQ96FX8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PERPQ96FX8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PERPQ96FX8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PERPQ96FX8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PERPQ96FX8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PERPQ96FX8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PERPQ96FX8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PERPQ96FX8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PERPQ96FX8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PERPQ96FX8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PERPQ96FX8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PERPQ96FX8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PERPQ96FX8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PERPQ96FX8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PERPQ96FX8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PERPQ96FX8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PERPQ96FX8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PERPQ96FX8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PERPQ96FX8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PERPQ96FX8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PERPQ96FX8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PERPQ96FX8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PERPQ96FX8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PERPQ96FX8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PERPQ96FX8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PERPQ96FX8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PERPQ96FX8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PERPQ96FX8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PERPQ96FX8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PERPQ96FX8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PERPQ96FX8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PERPQ96FX8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PERPQ96FX8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PERPQ96FX8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PERPQ96FX8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PERPQ96FX8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PERPQ96FX8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PERPQ96FX8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PERPQ96FX8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PERPQ96FX8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PERPQ96FX8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PERPQ96FX8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PERPQ96FX8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PERPQ96FX8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PERPQ96FX8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PERPQ96FX8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PERPQ96FX8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PERPQ96FX8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PERPQ96FX8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PERPQ96FX8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PERPQ96FX8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PERPQ96FX8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PERPQ96FX8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PERPQ96FX8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PERPQ96FX8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PERPQ96FX8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PERPQ96FX8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PERPQ96FX8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PERPQ96FX8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PERPQ96FX8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PERPQ96FX8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PERPQ96FX8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PERPQ96FX8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PERPQ96FX8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PERPQ96FX8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PERPQ96FX8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PERPQ96FX8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PERPQ96FX8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PERPQ96FX8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PERPQ96FX8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PERPQ96FX8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PERPQ96FX8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PERPQ96FX8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PERPQ96FX8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PERPQ96FX8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PERPQ96FX8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PERPQ96FX8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PERPQ96FX8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PERPQ96FX8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PERPQ96FX8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PERPQ96FX8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PERPQ96FX8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PERPQ96FX8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PERPQ96FX8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PERPQ96FX8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PERPQ96FX8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PERPQ96FX8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PERPQ96FX8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PERPQ96FX8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PERPQ96FX8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PERPQ96FX8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PERPQ96FX8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PERPQ96FX8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PERPQ96FX8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PERPQ96FX8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PERPQ96FX8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PERPQ96FX8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PERPQ96FX8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PERPQ96FX8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PERPQ96FX8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms