Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00526Q96FQ7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00526Q96FQ7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00526Q96FQ7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00526Q96FQ7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00526Q96FQ7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00526Q96FQ7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00526Q96FQ7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00526Q96FQ7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00526Q96FQ7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00526Q96FQ7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00526Q96FQ7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00526Q96FQ7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00526Q96FQ7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00526Q96FQ7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00526Q96FQ7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00526Q96FQ7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00526Q96FQ7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00526Q96FQ7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00526Q96FQ7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00526Q96FQ7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00526Q96FQ7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00526Q96FQ7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00526Q96FQ7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00526Q96FQ7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00526Q96FQ7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00526Q96FQ7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00526Q96FQ7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00526Q96FQ7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00526Q96FQ7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00526Q96FQ7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00526Q96FQ7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00526Q96FQ7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00526Q96FQ7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00526Q96FQ7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00526Q96FQ7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00526Q96FQ7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00526Q96FQ7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00526Q96FQ7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00526Q96FQ7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00526Q96FQ7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00526Q96FQ7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00526Q96FQ7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00526Q96FQ7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00526Q96FQ7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00526Q96FQ7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00526Q96FQ7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00526Q96FQ7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00526Q96FQ7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00526Q96FQ7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00526Q96FQ7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00526Q96FQ7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00526Q96FQ7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00526Q96FQ7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00526Q96FQ7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00526Q96FQ7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00526Q96FQ7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00526Q96FQ7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00526Q96FQ7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00526Q96FQ7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00526Q96FQ7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00526Q96FQ7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00526Q96FQ7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00526Q96FQ7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00526Q96FQ7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00526Q96FQ7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00526Q96FQ7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00526Q96FQ7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00526Q96FQ7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00526Q96FQ7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00526Q96FQ7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00526Q96FQ7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms