Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM8

ACSF2, Acyl-CoA synthetase family member 2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSF2Q96CM8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ACSF2Q96CM8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ACSF2Q96CM8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACSF2Q96CM8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ACSF2Q96CM8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ACSF2Q96CM8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ACSF2Q96CM8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ACSF2Q96CM8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ACSF2Q96CM8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ACSF2Q96CM8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ACSF2Q96CM8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACSF2Q96CM8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACSF2Q96CM8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACSF2Q96CM8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ACSF2Q96CM8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ACSF2Q96CM8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ACSF2Q96CM8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ACSF2Q96CM8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ACSF2Q96CM8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ACSF2Q96CM8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ACSF2Q96CM8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ACSF2Q96CM8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ACSF2Q96CM8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ACSF2Q96CM8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ACSF2Q96CM8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ACSF2Q96CM8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACSF2Q96CM8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACSF2Q96CM8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACSF2Q96CM8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ACSF2Q96CM8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACSF2Q96CM8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACSF2Q96CM8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACSF2Q96CM8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACSF2Q96CM8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ACSF2Q96CM8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ACSF2Q96CM8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACSF2Q96CM8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACSF2Q96CM8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACSF2Q96CM8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACSF2Q96CM8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ACSF2Q96CM8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACSF2Q96CM8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACSF2Q96CM8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACSF2Q96CM8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ACSF2Q96CM8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACSF2Q96CM8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ACSF2Q96CM8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ACSF2Q96CM8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACSF2Q96CM8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACSF2Q96CM8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACSF2Q96CM8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACSF2Q96CM8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACSF2Q96CM8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACSF2Q96CM8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACSF2Q96CM8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACSF2Q96CM8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ACSF2Q96CM8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ACSF2Q96CM8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ACSF2Q96CM8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACSF2Q96CM8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACSF2Q96CM8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ACSF2Q96CM8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ACSF2Q96CM8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACSF2Q96CM8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACSF2Q96CM8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACSF2Q96CM8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACSF2Q96CM8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACSF2Q96CM8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACSF2Q96CM8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACSF2Q96CM8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACSF2Q96CM8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACSF2Q96CM8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACSF2Q96CM8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACSF2Q96CM8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACSF2Q96CM8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACSF2Q96CM8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ACSF2Q96CM8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ACSF2Q96CM8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACSF2Q96CM8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACSF2Q96CM8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACSF2Q96CM8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACSF2Q96CM8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ACSF2Q96CM8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACSF2Q96CM8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ACSF2Q96CM8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACSF2Q96CM8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACSF2Q96CM8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACSF2Q96CM8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACSF2Q96CM8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACSF2Q96CM8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACSF2Q96CM8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACSF2Q96CM8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACSF2Q96CM8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACSF2Q96CM8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACSF2Q96CM8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACSF2Q96CM8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACSF2Q96CM8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACSF2Q96CM8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACSF2Q96CM8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACSF2Q96CM8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms