Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMIGD2Q96BF3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMIGD2Q96BF3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMIGD2Q96BF3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TMIGD2Q96BF3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMIGD2Q96BF3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMIGD2Q96BF3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMIGD2Q96BF3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMIGD2Q96BF3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMIGD2Q96BF3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMIGD2Q96BF3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMIGD2Q96BF3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMIGD2Q96BF3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMIGD2Q96BF3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMIGD2Q96BF3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMIGD2Q96BF3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMIGD2Q96BF3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMIGD2Q96BF3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMIGD2Q96BF3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMIGD2Q96BF3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMIGD2Q96BF3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMIGD2Q96BF3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMIGD2Q96BF3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMIGD2Q96BF3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMIGD2Q96BF3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMIGD2Q96BF3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMIGD2Q96BF3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMIGD2Q96BF3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMIGD2Q96BF3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMIGD2Q96BF3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMIGD2Q96BF3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMIGD2Q96BF3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMIGD2Q96BF3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMIGD2Q96BF3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMIGD2Q96BF3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMIGD2Q96BF3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMIGD2Q96BF3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMIGD2Q96BF3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMIGD2Q96BF3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMIGD2Q96BF3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMIGD2Q96BF3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMIGD2Q96BF3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMIGD2Q96BF3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMIGD2Q96BF3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMIGD2Q96BF3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMIGD2Q96BF3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMIGD2Q96BF3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMIGD2Q96BF3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMIGD2Q96BF3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMIGD2Q96BF3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMIGD2Q96BF3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMIGD2Q96BF3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMIGD2Q96BF3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMIGD2Q96BF3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMIGD2Q96BF3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMIGD2Q96BF3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMIGD2Q96BF3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMIGD2Q96BF3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMIGD2Q96BF3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMIGD2Q96BF3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMIGD2Q96BF3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMIGD2Q96BF3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMIGD2Q96BF3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMIGD2Q96BF3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMIGD2Q96BF3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMIGD2Q96BF3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMIGD2Q96BF3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMIGD2Q96BF3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMIGD2Q96BF3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMIGD2Q96BF3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMIGD2Q96BF3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMIGD2Q96BF3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMIGD2Q96BF3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMIGD2Q96BF3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMIGD2Q96BF3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMIGD2Q96BF3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMIGD2Q96BF3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMIGD2Q96BF3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMIGD2Q96BF3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMIGD2Q96BF3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMIGD2Q96BF3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMIGD2Q96BF3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMIGD2Q96BF3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMIGD2Q96BF3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMIGD2Q96BF3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMIGD2Q96BF3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMIGD2Q96BF3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMIGD2Q96BF3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMIGD2Q96BF3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMIGD2Q96BF3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMIGD2Q96BF3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMIGD2Q96BF3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMIGD2Q96BF3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMIGD2Q96BF3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMIGD2Q96BF3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMIGD2Q96BF3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMIGD2Q96BF3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMIGD2Q96BF3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMIGD2Q96BF3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMIGD2Q96BF3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms