Protein–RNA interactions for Protein: Q93034

CUL5, Cullin-5, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL5Q93034 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CUL5Q93034 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CUL5Q93034 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CUL5Q93034 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CUL5Q93034 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CUL5Q93034 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CUL5Q93034 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CUL5Q93034 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CUL5Q93034 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CUL5Q93034 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CUL5Q93034 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CUL5Q93034 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CUL5Q93034 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CUL5Q93034 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CUL5Q93034 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CUL5Q93034 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CUL5Q93034 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CUL5Q93034 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
CUL5Q93034 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CUL5Q93034 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CUL5Q93034 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CUL5Q93034 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CUL5Q93034 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CUL5Q93034 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CUL5Q93034 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CUL5Q93034 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CUL5Q93034 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CUL5Q93034 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CUL5Q93034 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CUL5Q93034 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CUL5Q93034 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CUL5Q93034 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CUL5Q93034 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CUL5Q93034 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CUL5Q93034 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CUL5Q93034 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CUL5Q93034 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CUL5Q93034 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CUL5Q93034 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CUL5Q93034 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CUL5Q93034 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CUL5Q93034 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CUL5Q93034 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CUL5Q93034 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CUL5Q93034 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CUL5Q93034 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CUL5Q93034 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CUL5Q93034 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CUL5Q93034 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CUL5Q93034 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CUL5Q93034 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CUL5Q93034 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CUL5Q93034 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CUL5Q93034 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CUL5Q93034 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CUL5Q93034 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CUL5Q93034 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CUL5Q93034 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CUL5Q93034 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CUL5Q93034 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CUL5Q93034 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CUL5Q93034 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CUL5Q93034 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CUL5Q93034 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CUL5Q93034 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CUL5Q93034 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CUL5Q93034 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CUL5Q93034 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CUL5Q93034 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CUL5Q93034 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CUL5Q93034 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CUL5Q93034 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CUL5Q93034 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CUL5Q93034 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CUL5Q93034 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CUL5Q93034 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CUL5Q93034 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CUL5Q93034 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CUL5Q93034 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CUL5Q93034 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CUL5Q93034 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CUL5Q93034 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CUL5Q93034 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CUL5Q93034 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CUL5Q93034 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CUL5Q93034 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CUL5Q93034 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CUL5Q93034 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CUL5Q93034 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CUL5Q93034 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CUL5Q93034 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CUL5Q93034 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CUL5Q93034 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.45
CUL5Q93034 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
CUL5Q93034 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CUL5Q93034 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CUL5Q93034 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CUL5Q93034 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CUL5Q93034 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CUL5Q93034 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms