Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEMA4DQ92854 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEMA4DQ92854 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEMA4DQ92854 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEMA4DQ92854 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEMA4DQ92854 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEMA4DQ92854 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEMA4DQ92854 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEMA4DQ92854 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEMA4DQ92854 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEMA4DQ92854 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEMA4DQ92854 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA4DQ92854 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA4DQ92854 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMA4DQ92854 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SEMA4DQ92854 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEMA4DQ92854 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEMA4DQ92854 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SEMA4DQ92854 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEMA4DQ92854 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEMA4DQ92854 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEMA4DQ92854 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEMA4DQ92854 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEMA4DQ92854 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEMA4DQ92854 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEMA4DQ92854 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEMA4DQ92854 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEMA4DQ92854 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEMA4DQ92854 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEMA4DQ92854 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEMA4DQ92854 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SEMA4DQ92854 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEMA4DQ92854 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEMA4DQ92854 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SEMA4DQ92854 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEMA4DQ92854 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEMA4DQ92854 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEMA4DQ92854 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEMA4DQ92854 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEMA4DQ92854 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEMA4DQ92854 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SEMA4DQ92854 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SEMA4DQ92854 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SEMA4DQ92854 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SEMA4DQ92854 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SEMA4DQ92854 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEMA4DQ92854 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEMA4DQ92854 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SEMA4DQ92854 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEMA4DQ92854 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEMA4DQ92854 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEMA4DQ92854 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEMA4DQ92854 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEMA4DQ92854 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEMA4DQ92854 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEMA4DQ92854 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEMA4DQ92854 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEMA4DQ92854 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEMA4DQ92854 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEMA4DQ92854 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEMA4DQ92854 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEMA4DQ92854 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEMA4DQ92854 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEMA4DQ92854 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEMA4DQ92854 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEMA4DQ92854 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEMA4DQ92854 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEMA4DQ92854 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEMA4DQ92854 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEMA4DQ92854 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEMA4DQ92854 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SEMA4DQ92854 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEMA4DQ92854 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEMA4DQ92854 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEMA4DQ92854 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEMA4DQ92854 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEMA4DQ92854 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEMA4DQ92854 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEMA4DQ92854 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA4DQ92854 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA4DQ92854 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA4DQ92854 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA4DQ92854 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA4DQ92854 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEMA4DQ92854 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEMA4DQ92854 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEMA4DQ92854 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEMA4DQ92854 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEMA4DQ92854 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEMA4DQ92854 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEMA4DQ92854 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEMA4DQ92854 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SEMA4DQ92854 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEMA4DQ92854 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEMA4DQ92854 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEMA4DQ92854 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEMA4DQ92854 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEMA4DQ92854 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEMA4DQ92854 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SEMA4DQ92854 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms