Protein–RNA interactions for Protein: Q92747

ARPC1A, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1AQ92747 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARPC1AQ92747 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARPC1AQ92747 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARPC1AQ92747 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARPC1AQ92747 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARPC1AQ92747 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARPC1AQ92747 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARPC1AQ92747 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARPC1AQ92747 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARPC1AQ92747 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARPC1AQ92747 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARPC1AQ92747 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARPC1AQ92747 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARPC1AQ92747 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARPC1AQ92747 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARPC1AQ92747 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARPC1AQ92747 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARPC1AQ92747 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARPC1AQ92747 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARPC1AQ92747 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARPC1AQ92747 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARPC1AQ92747 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARPC1AQ92747 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARPC1AQ92747 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARPC1AQ92747 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARPC1AQ92747 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARPC1AQ92747 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARPC1AQ92747 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARPC1AQ92747 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARPC1AQ92747 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARPC1AQ92747 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARPC1AQ92747 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARPC1AQ92747 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARPC1AQ92747 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARPC1AQ92747 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARPC1AQ92747 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ARPC1AQ92747 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARPC1AQ92747 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARPC1AQ92747 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARPC1AQ92747 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARPC1AQ92747 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARPC1AQ92747 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ARPC1AQ92747 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARPC1AQ92747 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARPC1AQ92747 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ARPC1AQ92747 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ARPC1AQ92747 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARPC1AQ92747 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ARPC1AQ92747 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARPC1AQ92747 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARPC1AQ92747 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARPC1AQ92747 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ARPC1AQ92747 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARPC1AQ92747 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARPC1AQ92747 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARPC1AQ92747 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARPC1AQ92747 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARPC1AQ92747 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARPC1AQ92747 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ARPC1AQ92747 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARPC1AQ92747 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARPC1AQ92747 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARPC1AQ92747 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARPC1AQ92747 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARPC1AQ92747 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARPC1AQ92747 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARPC1AQ92747 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARPC1AQ92747 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARPC1AQ92747 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARPC1AQ92747 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARPC1AQ92747 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARPC1AQ92747 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ARPC1AQ92747 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms