Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBXN4Q92575 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBXN4Q92575 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBXN4Q92575 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBXN4Q92575 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBXN4Q92575 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBXN4Q92575 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBXN4Q92575 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBXN4Q92575 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBXN4Q92575 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
UBXN4Q92575 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
UBXN4Q92575 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
UBXN4Q92575 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBXN4Q92575 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBXN4Q92575 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBXN4Q92575 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBXN4Q92575 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBXN4Q92575 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBXN4Q92575 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBXN4Q92575 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBXN4Q92575 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBXN4Q92575 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
UBXN4Q92575 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBXN4Q92575 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBXN4Q92575 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBXN4Q92575 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBXN4Q92575 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBXN4Q92575 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBXN4Q92575 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBXN4Q92575 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBXN4Q92575 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBXN4Q92575 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
UBXN4Q92575 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBXN4Q92575 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBXN4Q92575 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBXN4Q92575 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBXN4Q92575 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBXN4Q92575 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBXN4Q92575 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBXN4Q92575 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBXN4Q92575 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBXN4Q92575 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBXN4Q92575 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBXN4Q92575 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
UBXN4Q92575 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBXN4Q92575 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBXN4Q92575 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBXN4Q92575 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBXN4Q92575 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBXN4Q92575 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBXN4Q92575 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBXN4Q92575 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBXN4Q92575 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBXN4Q92575 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBXN4Q92575 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBXN4Q92575 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBXN4Q92575 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBXN4Q92575 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBXN4Q92575 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBXN4Q92575 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBXN4Q92575 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBXN4Q92575 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBXN4Q92575 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBXN4Q92575 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBXN4Q92575 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
UBXN4Q92575 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBXN4Q92575 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UBXN4Q92575 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UBXN4Q92575 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UBXN4Q92575 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UBXN4Q92575 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UBXN4Q92575 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBXN4Q92575 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBXN4Q92575 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBXN4Q92575 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBXN4Q92575 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBXN4Q92575 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBXN4Q92575 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBXN4Q92575 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBXN4Q92575 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBXN4Q92575 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBXN4Q92575 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBXN4Q92575 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBXN4Q92575 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBXN4Q92575 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBXN4Q92575 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBXN4Q92575 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
UBXN4Q92575 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
UBXN4Q92575 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBXN4Q92575 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBXN4Q92575 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBXN4Q92575 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBXN4Q92575 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBXN4Q92575 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBXN4Q92575 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBXN4Q92575 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBXN4Q92575 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBXN4Q92575 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBXN4Q92575 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBXN4Q92575 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms