Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMPDL3BQ92485 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMPDL3BQ92485 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMPDL3BQ92485 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMPDL3BQ92485 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMPDL3BQ92485 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMPDL3BQ92485 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMPDL3BQ92485 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMPDL3BQ92485 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMPDL3BQ92485 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMPDL3BQ92485 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMPDL3BQ92485 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMPDL3BQ92485 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMPDL3BQ92485 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMPDL3BQ92485 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMPDL3BQ92485 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPDL3BQ92485 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPDL3BQ92485 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMPDL3BQ92485 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMPDL3BQ92485 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMPDL3BQ92485 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMPDL3BQ92485 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMPDL3BQ92485 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMPDL3BQ92485 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMPDL3BQ92485 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMPDL3BQ92485 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPDL3BQ92485 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPDL3BQ92485 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPDL3BQ92485 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPDL3BQ92485 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPDL3BQ92485 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPDL3BQ92485 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMPDL3BQ92485 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMPDL3BQ92485 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMPDL3BQ92485 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMPDL3BQ92485 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMPDL3BQ92485 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMPDL3BQ92485 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPDL3BQ92485 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMPDL3BQ92485 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMPDL3BQ92485 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMPDL3BQ92485 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMPDL3BQ92485 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMPDL3BQ92485 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMPDL3BQ92485 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMPDL3BQ92485 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMPDL3BQ92485 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMPDL3BQ92485 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMPDL3BQ92485 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMPDL3BQ92485 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMPDL3BQ92485 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMPDL3BQ92485 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMPDL3BQ92485 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMPDL3BQ92485 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMPDL3BQ92485 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPDL3BQ92485 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPDL3BQ92485 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPDL3BQ92485 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPDL3BQ92485 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPDL3BQ92485 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPDL3BQ92485 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPDL3BQ92485 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPDL3BQ92485 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPDL3BQ92485 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPDL3BQ92485 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPDL3BQ92485 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPDL3BQ92485 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPDL3BQ92485 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPDL3BQ92485 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPDL3BQ92485 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPDL3BQ92485 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPDL3BQ92485 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPDL3BQ92485 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPDL3BQ92485 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPDL3BQ92485 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMPDL3BQ92485 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPDL3BQ92485 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPDL3BQ92485 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPDL3BQ92485 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPDL3BQ92485 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPDL3BQ92485 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPDL3BQ92485 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPDL3BQ92485 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPDL3BQ92485 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPDL3BQ92485 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPDL3BQ92485 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPDL3BQ92485 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPDL3BQ92485 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPDL3BQ92485 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPDL3BQ92485 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPDL3BQ92485 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPDL3BQ92485 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPDL3BQ92485 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPDL3BQ92485 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPDL3BQ92485 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPDL3BQ92485 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPDL3BQ92485 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMPDL3BQ92485 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMPDL3BQ92485 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMPDL3BQ92485 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms