Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CKAP2Q8WWK9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CKAP2Q8WWK9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CKAP2Q8WWK9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CKAP2Q8WWK9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CKAP2Q8WWK9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CKAP2Q8WWK9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CKAP2Q8WWK9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CKAP2Q8WWK9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CKAP2Q8WWK9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CKAP2Q8WWK9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CKAP2Q8WWK9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CKAP2Q8WWK9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CKAP2Q8WWK9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CKAP2Q8WWK9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CKAP2Q8WWK9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CKAP2Q8WWK9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CKAP2Q8WWK9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CKAP2Q8WWK9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CKAP2Q8WWK9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CKAP2Q8WWK9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CKAP2Q8WWK9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CKAP2Q8WWK9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CKAP2Q8WWK9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CKAP2Q8WWK9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CKAP2Q8WWK9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CKAP2Q8WWK9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CKAP2Q8WWK9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CKAP2Q8WWK9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CKAP2Q8WWK9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CKAP2Q8WWK9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CKAP2Q8WWK9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CKAP2Q8WWK9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CKAP2Q8WWK9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CKAP2Q8WWK9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CKAP2Q8WWK9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CKAP2Q8WWK9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CKAP2Q8WWK9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CKAP2Q8WWK9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CKAP2Q8WWK9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CKAP2Q8WWK9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CKAP2Q8WWK9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CKAP2Q8WWK9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CKAP2Q8WWK9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKAP2Q8WWK9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKAP2Q8WWK9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKAP2Q8WWK9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CKAP2Q8WWK9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CKAP2Q8WWK9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CKAP2Q8WWK9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CKAP2Q8WWK9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CKAP2Q8WWK9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CKAP2Q8WWK9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CKAP2Q8WWK9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CKAP2Q8WWK9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CKAP2Q8WWK9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CKAP2Q8WWK9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CKAP2Q8WWK9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CKAP2Q8WWK9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CKAP2Q8WWK9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CKAP2Q8WWK9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CKAP2Q8WWK9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CKAP2Q8WWK9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CKAP2Q8WWK9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CKAP2Q8WWK9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CKAP2Q8WWK9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CKAP2Q8WWK9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CKAP2Q8WWK9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CKAP2Q8WWK9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CKAP2Q8WWK9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CKAP2Q8WWK9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CKAP2Q8WWK9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CKAP2Q8WWK9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CKAP2Q8WWK9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CKAP2Q8WWK9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CKAP2Q8WWK9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CKAP2Q8WWK9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CKAP2Q8WWK9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CKAP2Q8WWK9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CKAP2Q8WWK9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CKAP2Q8WWK9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CKAP2Q8WWK9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CKAP2Q8WWK9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CKAP2Q8WWK9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CKAP2Q8WWK9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CKAP2Q8WWK9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CKAP2Q8WWK9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CKAP2Q8WWK9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CKAP2Q8WWK9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CKAP2Q8WWK9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CKAP2Q8WWK9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CKAP2Q8WWK9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CKAP2Q8WWK9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CKAP2Q8WWK9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CKAP2Q8WWK9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CKAP2Q8WWK9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CKAP2Q8WWK9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CKAP2Q8WWK9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CKAP2Q8WWK9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CKAP2Q8WWK9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms